268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2234 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 366 aa  738    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  56.88 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  54.52 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  54.23 
 
 		 370 aa  388  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  44.35 
 
 		 378 aa  296  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  39.07 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  37.98 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  36.61 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  36.76 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  37.16 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  35.14 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  38.59 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  36.19 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  35.45 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  33.61 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  36 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  37.54 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.36 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  34.52 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  34.37 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  31.62 
 
 		 334 aa  189  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  32.43 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  32.16 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  34.62 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  33.52 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  33.62 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  31.82 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  32.28 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  31.78 
 
 		 335 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  32.68 
 
 		 363 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  28.95 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  31.05 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  30.36 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  29.79 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  31.61 
 
 		 350 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 368 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  31.9 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  30.88 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  29.49 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  29.26 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  30.4 
 
 		 354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  29.75 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  29.6 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  31.56 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  33.82 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  29.6 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  28.49 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  29.6 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  29.75 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  29.6 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  29.6 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  29.6 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  29.6 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  29.6 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  30.32 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  28.13 
 
 		 389 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  28.37 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  28.49 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  28.68 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  29.58 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  25.75 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  29.5 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  27.3 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  26.4 
 
 		 340 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  31.42 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  29.33 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  28.93 
 
 		 354 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  27.91 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  30.84 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  28.5 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  29.65 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  28.08 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  28.12 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  28.52 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  29.69 
 
 		 403 aa  126  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  29.38 
 
 		 380 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  27.92 
 
 		 357 aa  126  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.02 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  27.97 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  27.47 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  27.27 
 
 		 386 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  26.94 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  25.29 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  26.42 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  37.2 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  26.72 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  27.1 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  27.97 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  24.65 
 
 		 356 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  28.37 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0635  basic membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  27.67 
 
 		 713 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  24.93 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4441  basic membrane lipoprotein  25.16 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0481892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  24.09 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  25.64 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>