282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2515 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
353 aa  712    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  38.84 
 
 
353 aa  239  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  38.46 
 
 
359 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  38.46 
 
 
359 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  35.38 
 
 
366 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  34.81 
 
 
366 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  37.19 
 
 
365 aa  212  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  36.6 
 
 
335 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  35.5 
 
 
366 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  33.82 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  36.94 
 
 
404 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  35.99 
 
 
346 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  41.18 
 
 
407 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  38.96 
 
 
413 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  39.51 
 
 
403 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  37.24 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  34.71 
 
 
337 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  37.01 
 
 
354 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  35.93 
 
 
351 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  33.15 
 
 
363 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  33.44 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  34.58 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  31.78 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  33.85 
 
 
358 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  34.08 
 
 
355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  28.94 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  32.01 
 
 
355 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  32.01 
 
 
355 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  32.01 
 
 
355 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  32.01 
 
 
355 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  34.26 
 
 
330 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  32.01 
 
 
355 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  33.12 
 
 
342 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  31.4 
 
 
355 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  31.73 
 
 
356 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  29.32 
 
 
340 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  31.4 
 
 
355 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  28.85 
 
 
347 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  30.29 
 
 
358 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  34.82 
 
 
334 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 
339 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  36.14 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  31.15 
 
 
358 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  33.44 
 
 
346 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  32.37 
 
 
357 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  31.68 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  32.57 
 
 
713 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  28.98 
 
 
356 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  32.78 
 
 
330 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  31.35 
 
 
331 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  33.02 
 
 
330 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  31.48 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  33.79 
 
 
341 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  31.96 
 
 
327 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  32.34 
 
 
347 aa  142  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.64 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  29.77 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  32.64 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  34.11 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  29.67 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  34.77 
 
 
334 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  27.25 
 
 
370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  28.76 
 
 
378 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  31.51 
 
 
368 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  30.75 
 
 
370 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  30.41 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  30.66 
 
 
328 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
330 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  32.79 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  32.22 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  30.86 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  31.88 
 
 
386 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  32.08 
 
 
356 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  31.97 
 
 
329 aa  132  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  29.73 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  28.69 
 
 
376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  29.66 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  31.84 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  31.93 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  30.77 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  30.85 
 
 
358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  32.17 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  31.32 
 
 
356 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  30.46 
 
 
365 aa  129  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  33.96 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  29.74 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  30.88 
 
 
322 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  31.23 
 
 
330 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0782  basic membrane lipoprotein  31.96 
 
 
384 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.971667  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  29.43 
 
 
356 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  30.94 
 
 
356 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  30 
 
 
341 aa  125  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  29.67 
 
 
380 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  28.88 
 
 
371 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  31.48 
 
 
357 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  30.79 
 
 
357 aa  122  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  34.48 
 
 
382 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  30.21 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>