229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  100 
 
 		 365 aa  720    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  61.14 
 
 		 371 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  53.1 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  53.43 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2947  basic membrane lipoprotein  57.02 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0994  basic membrane lipoprotein  59.73 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  53.97 
 
 		 358 aa  345  8.999999999999999e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04890  uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein  48.37 
 
 		 385 aa  325  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  46.32 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0807  basic membrane lipoprotein  45.28 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0751  basic membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191931  hitchhiker  0.00640834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  45.78 
 
 		 368 aa  286  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3949  basic membrane lipoprotein  40.8 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.017082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0782  basic membrane lipoprotein  41.64 
 
 		 384 aa  235  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.971667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  39.83 
 
 		 358 aa  235  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  37.27 
 
 		 355 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  32.85 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  34.67 
 
 		 335 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  35.93 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  35.9 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  35.58 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  32.1 
 
 		 356 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  32.07 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  31.38 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  30.99 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  31.59 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  32.25 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  32.25 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  33.61 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  33.45 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  32.62 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  32.66 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  34.15 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  30.79 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  32.51 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  32.73 
 
 		 713 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  32.76 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  31.66 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  32.12 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  30.99 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  31.29 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  31.55 
 
 		 358 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  34.44 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  33.96 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  30.57 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  31.73 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  30.65 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  30.23 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  31.76 
 
 		 349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  30.7 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  30.75 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  33.86 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  30.14 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  29.92 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  32.38 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  30.14 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  30.14 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.38 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  30.14 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  32.38 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  30.14 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  32.09 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  29.86 
 
 		 355 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  30.14 
 
 		 355 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  27.55 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  32.94 
 
 		 329 aa  126  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  32.79 
 
 		 358 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  27 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  32.72 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  30.08 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  30.94 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  31.25 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  29.71 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  30.53 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  32.77 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  27.78 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  30.7 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  31.07 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  31.83 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  30.03 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  30.34 
 
 		 364 aa  119  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  33.71 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  30.17 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  28.37 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  28.5 
 
 		 380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  30.12 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  27.81 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  30.82 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  29.85 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  28.53 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3269  basic membrane lipoprotein  29.71 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000111252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  32.36 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  28.34 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 		 322 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  29.11 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>