255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0904 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
330 aa  657    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  35.96 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  31.65 
 
 
358 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  34.77 
 
 
356 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  34.45 
 
 
342 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  31.39 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  32.79 
 
 
346 aa  172  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  31.19 
 
 
340 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  33.01 
 
 
331 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  32.9 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  32.92 
 
 
330 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  34.42 
 
 
356 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  32.88 
 
 
335 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  34.89 
 
 
327 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  33.23 
 
 
330 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  31.79 
 
 
330 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  31.27 
 
 
337 aa  155  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  31.33 
 
 
339 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  31.46 
 
 
361 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  31.04 
 
 
358 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  31.94 
 
 
355 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  31.94 
 
 
355 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  31.48 
 
 
347 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  31.56 
 
 
330 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  31.61 
 
 
358 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  31.61 
 
 
355 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  31.61 
 
 
355 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  31.61 
 
 
355 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  31.61 
 
 
355 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  33.01 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  31.61 
 
 
355 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  27.72 
 
 
357 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  30.51 
 
 
340 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  30.61 
 
 
363 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  35.16 
 
 
328 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  34.92 
 
 
354 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  30.25 
 
 
358 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  30.89 
 
 
389 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  31.03 
 
 
363 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  31.3 
 
 
334 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.37 
 
 
331 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  31.37 
 
 
331 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  31.21 
 
 
334 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  31.37 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  36.04 
 
 
347 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  31.92 
 
 
330 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  34.24 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  29.5 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  36.43 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  29.55 
 
 
366 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  35.21 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  31.27 
 
 
334 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1075  basic membrane lipoprotein  29.68 
 
 
404 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00227041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  32.75 
 
 
360 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  29.28 
 
 
331 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4441  basic membrane lipoprotein  29.55 
 
 
368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0481892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  29.68 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  28.53 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  28.08 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  31.72 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  31.3 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0010  Bmp family lipoprotein  29.41 
 
 
368 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0007  Bmp family lipoprotein  29.41 
 
 
368 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  31.31 
 
 
353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  27.85 
 
 
329 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  32.27 
 
 
368 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  31.21 
 
 
358 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  30 
 
 
334 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  31.79 
 
 
382 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  28.93 
 
 
713 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  31.76 
 
 
413 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  28.75 
 
 
356 aa  123  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  33.21 
 
 
368 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  27.7 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  28.91 
 
 
365 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  29.43 
 
 
365 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  31.07 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  28.61 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  29.9 
 
 
386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  26.63 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  30.92 
 
 
404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3919  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 
566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.308906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  26.63 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  28.75 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  26.92 
 
 
322 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  26.85 
 
 
351 aa  116  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  32.21 
 
 
349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  28.06 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  28.01 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  31.01 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  30.58 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  29.45 
 
 
350 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  26.33 
 
 
366 aa  112  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  26.96 
 
 
370 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  28.05 
 
 
341 aa  108  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  26.4 
 
 
361 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  27.8 
 
 
357 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  28.02 
 
 
347 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0693  ABC transporter periplasmic protein  26.44 
 
 
371 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000138325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  27.14 
 
 
380 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>