149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1075 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1075  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
404 aa  798    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00227041  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  32.61 
 
 
347 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  31.27 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  30.42 
 
 
340 aa  139  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  30.35 
 
 
346 aa  139  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  32.65 
 
 
346 aa  136  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  30.38 
 
 
358 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  29.68 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  31.87 
 
 
334 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  29.69 
 
 
354 aa  133  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  27.53 
 
 
360 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  28.24 
 
 
356 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  27.65 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  30.39 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  30.25 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  30.25 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  30.25 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  28.88 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  26.9 
 
 
351 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  30.25 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  30.39 
 
 
355 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  29.61 
 
 
358 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  30.25 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  30.81 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  30.06 
 
 
330 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  28.34 
 
 
358 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  27.27 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  28.39 
 
 
338 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  28.44 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  28.3 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  29.51 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  26.63 
 
 
356 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  31.62 
 
 
329 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  27.41 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  28.86 
 
 
357 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  30.16 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  28.64 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  26.84 
 
 
363 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  30.56 
 
 
357 aa  111  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  28.94 
 
 
350 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  29.53 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  29.88 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  30.21 
 
 
358 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  30.9 
 
 
331 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  28.07 
 
 
332 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  28.99 
 
 
368 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.78 
 
 
331 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  27.78 
 
 
331 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  30.17 
 
 
334 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  29.77 
 
 
329 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  29.27 
 
 
330 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  28.74 
 
 
331 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0755  basic membrane lipoprotein  26.58 
 
 
387 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  29.45 
 
 
339 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  25.26 
 
 
365 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  30.39 
 
 
322 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  29.21 
 
 
330 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  26.42 
 
 
327 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  26.83 
 
 
368 aa  103  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  27.73 
 
 
340 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  27.94 
 
 
330 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  29.29 
 
 
354 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  28.06 
 
 
361 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  29.21 
 
 
329 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  30.36 
 
 
337 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3269  basic membrane lipoprotein  27.35 
 
 
389 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000111252  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  28.37 
 
 
377 aa  99.8  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  27.05 
 
 
334 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3175  basic membrane lipoprotein  28.42 
 
 
400 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142752  normal  0.23342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  32.88 
 
 
328 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  26.71 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  29.48 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  28.46 
 
 
349 aa  96.7  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  27.64 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  28.27 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  27.65 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  27.65 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  28.33 
 
 
366 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2259  basic membrane lipoprotein  26.92 
 
 
394 aa  93.2  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000485708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  28.34 
 
 
347 aa  92.8  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  29.14 
 
 
407 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  26.85 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  27.41 
 
 
386 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  29.78 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  28.85 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  25.62 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  24.8 
 
 
351 aa  91.3  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3919  basic membrane lipoprotein  30.94 
 
 
566 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.308906  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  24 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  27.18 
 
 
331 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0960  basic membrane lipoprotein  26.86 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  27.5 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  28.62 
 
 
389 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  27.01 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  26.98 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  24.16 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  28.12 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  24.22 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  25.92 
 
 
339 aa  84  0.000000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  25.26 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>