174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1020 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
368 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  46.34 
 
 
371 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  45.1 
 
 
368 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  45.56 
 
 
356 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  45.78 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  45.63 
 
 
358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04890  uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein  41.8 
 
 
385 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651216  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2947  basic membrane lipoprotein  43.18 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  39.89 
 
 
357 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0994  basic membrane lipoprotein  45.08 
 
 
360 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0807  basic membrane lipoprotein  40.16 
 
 
359 aa  225  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0751  basic membrane lipoprotein  40.71 
 
 
364 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191931  hitchhiker  0.00640834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3949  basic membrane lipoprotein  37.54 
 
 
363 aa  205  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.017082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  36.76 
 
 
358 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0782  basic membrane lipoprotein  31.34 
 
 
384 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.971667  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  28.33 
 
 
351 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  31.76 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  31.76 
 
 
356 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  32.17 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  29.89 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  28.76 
 
 
355 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  30.08 
 
 
363 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  31.01 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  31.48 
 
 
386 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  28.86 
 
 
363 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  30.53 
 
 
340 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  27.14 
 
 
353 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  28.29 
 
 
358 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  30.05 
 
 
370 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  28.16 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  27.37 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  29.22 
 
 
335 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  29.41 
 
 
713 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  28.69 
 
 
346 aa  116  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  28.24 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  28 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  28 
 
 
364 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  28.22 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2259  basic membrane lipoprotein  31.01 
 
 
394 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000485708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  27.05 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3269  basic membrane lipoprotein  30.5 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000111252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  30.34 
 
 
332 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  27.3 
 
 
370 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  27.35 
 
 
359 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  28.38 
 
 
334 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  27.35 
 
 
359 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  25.98 
 
 
355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  27.82 
 
 
351 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  33.45 
 
 
356 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  26.57 
 
 
366 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  26.49 
 
 
353 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  28.82 
 
 
330 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.24 
 
 
349 aa  106  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  27.25 
 
 
360 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  25.7 
 
 
355 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  25.7 
 
 
355 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  25.7 
 
 
355 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  25.7 
 
 
355 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  25.7 
 
 
355 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  28.18 
 
 
331 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  25.42 
 
 
355 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  25.8 
 
 
358 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  26.41 
 
 
357 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  26.63 
 
 
330 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0755  basic membrane lipoprotein  28.97 
 
 
387 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  26.33 
 
 
347 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  26.69 
 
 
354 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  26.86 
 
 
357 aa  102  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  27.33 
 
 
330 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  28.32 
 
 
383 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  26.06 
 
 
356 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  30 
 
 
350 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  27.54 
 
 
334 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  26.45 
 
 
376 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  28.11 
 
 
330 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 
331 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  29.82 
 
 
382 aa  99.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  25.48 
 
 
340 aa  99.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  24.86 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  25.5 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.08 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  27.08 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  27.62 
 
 
339 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  30.35 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  27.4 
 
 
407 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  27.06 
 
 
413 aa  92.8  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  27.37 
 
 
334 aa  93.2  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  26.69 
 
 
330 aa  92.8  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  27.02 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  28.11 
 
 
404 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  28.61 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  26.84 
 
 
341 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  24.54 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3175  basic membrane lipoprotein  27.11 
 
 
400 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142752  normal  0.23342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  27.71 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  28.27 
 
 
403 aa  89  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  24.49 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0961  basic membrane lipoprotein  28.72 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  26.51 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>