271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2121 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2121  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 348 aa  688    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6254  basic membrane lipoprotein  43.37 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  30.38 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  31.1 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  31.01 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  31.93 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  29.97 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  31.06 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  34.47 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  33.11 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  33.79 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  28.74 
 
 		 354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  30.1 
 
 		 351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  31.36 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  30.95 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  29.43 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  31.05 
 
 		 713 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  29.01 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  29.68 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  27.06 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  29.34 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  30.21 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  29.95 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  32.3 
 
 		 334 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  27.6 
 
 		 355 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  31.03 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  32.65 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  29.95 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  27.6 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  31.74 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  27.6 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  26.62 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  31.23 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  26.95 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  26.95 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  26.95 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  26.95 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  25.59 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  28.94 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  26.95 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  29.53 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.31 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  28.72 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  31.31 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  29.05 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  31.33 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  29.93 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  30.03 
 
 		 358 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  27.99 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  28.33 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  30.23 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  30.74 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  31.23 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  28.32 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  26.65 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  31.31 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  27.12 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  27.89 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  27.41 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  29.45 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  27.85 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  24.78 
 
 		 377 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  26.92 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  25.44 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  29.07 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  30.27 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  26.23 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  28.96 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  26.73 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  31.62 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  24.67 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  27.92 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  27.43 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  25.81 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  26.07 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4441  basic membrane lipoprotein  28.3 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0481892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  24.64 
 
 		 368 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  27.7 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  26.69 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  32.02 
 
 		 348 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  27.13 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  25.44 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  28.62 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  28.93 
 
 		 403 aa  94  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  28.12 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  28.83 
 
 		 407 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0635  basic membrane lipoprotein  29.91 
 
 		 352 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  26.99 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  28.19 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  26.29 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  30.28 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  29.53 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  28.69 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  26.44 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  31.71 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>