251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0824 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 358 aa  719    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  53.97 
 
 		 365 aa  355  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  51.19 
 
 		 356 aa  346  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  51.36 
 
 		 371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  48.74 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2947  basic membrane lipoprotein  52.13 
 
 		 375 aa  298  8e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  44.32 
 
 		 357 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04890  uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein  46.09 
 
 		 385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651216  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0994  basic membrane lipoprotein  52.91 
 
 		 360 aa  285  9e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  45.63 
 
 		 368 aa  276  6e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3949  basic membrane lipoprotein  45.91 
 
 		 363 aa  275  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.017082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0807  basic membrane lipoprotein  42.66 
 
 		 359 aa  248  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0751  basic membrane lipoprotein  43.5 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191931  hitchhiker  0.00640834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  40.78 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0782  basic membrane lipoprotein  35.69 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.971667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  35.76 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  35.39 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  35.74 
 
 		 713 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  32.79 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  34.14 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  32.43 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  34.25 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  33.79 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  31.08 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  32.87 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  34.19 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  32.46 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  31.53 
 
 		 340 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  34.27 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  31.78 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  32.8 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  29.64 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  30.9 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  30.41 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  30.95 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  30.68 
 
 		 359 aa  142  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  30.68 
 
 		 359 aa  142  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  30.32 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  34.62 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  33.96 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  30.21 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  30.61 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  33.72 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  30.64 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  28.86 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  32.42 
 
 		 351 aa  136  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  30.35 
 
 		 355 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  32.26 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  30.06 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  30.06 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  30.06 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  30.06 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  30.41 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  33.44 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  29.77 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  29.57 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  31.66 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  34.3 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  30.75 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  30.41 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  33.94 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  29.48 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  26.48 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  33.86 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  28.32 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  30.65 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.77 
 
 		 331 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  29.02 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  29.77 
 
 		 331 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  27.84 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  28.65 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  26.74 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  29.51 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  30.65 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  31.33 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  31.69 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  30 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  32.48 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  30.03 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  29.82 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  28.9 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  28.93 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  30.5 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  30.59 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  30.49 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  29 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  31.29 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  31.25 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  29.52 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  29.61 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  30.32 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  28.49 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2121  basic membrane lipoprotein  30.55 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  29.79 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  26.08 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  29.26 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  29.34 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>