189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0807 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0807  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 359 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0751  basic membrane lipoprotein  91.09 
 
 		 364 aa  644    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191931  hitchhiker  0.00640834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  52.81 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  49.45 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  50.29 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3949  basic membrane lipoprotein  50.44 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.017082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  46.81 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  45.61 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04890  uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein  45.5 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  45.14 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0782  basic membrane lipoprotein  49.09 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.971667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2947  basic membrane lipoprotein  43.18 
 
 		 375 aa  262  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  42.73 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0994  basic membrane lipoprotein  44.64 
 
 		 360 aa  233  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  39.66 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  34.6 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  32.8 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  32.07 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  32.89 
 
 		 377 aa  159  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  32.24 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  34.45 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  35.53 
 
 		 356 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  35.22 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  30.15 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  31.34 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  34.23 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  30.45 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  31.04 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  31.04 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  31.04 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  31.04 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  31.04 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  31.04 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  34.71 
 
 		 386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  32.07 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  32.35 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  32.07 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  33.13 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  32.01 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  31.21 
 
 		 361 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  32.61 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  30.91 
 
 		 713 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  32 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  31.67 
 
 		 365 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  30.65 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  31.09 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  30.09 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  29.69 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  30.95 
 
 		 361 aa  122  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  35.96 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  29.59 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  29.41 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  28.65 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  30.59 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  29.3 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  31.21 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  28.8 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  30.48 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  32.18 
 
 		 346 aa  113  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  30.67 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  31.53 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  28.95 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  29.69 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  32.09 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  30 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.92 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  28.66 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  28.98 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  30.06 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  29.9 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  28.66 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  31.11 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  30.85 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  32.27 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  28.29 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  31.11 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  28.15 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  27.64 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.99 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  27.99 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  28.75 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  28.41 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  29.18 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  31.17 
 
 		 350 aa  99.8  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  28.89 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  30.32 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  28 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  29.1 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  29.55 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  30.65 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  32.01 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  32.06 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  31.1 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  27.07 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  28.05 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  32.17 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  29.41 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  29.71 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  30.89 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>