171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0782 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0782  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
384 aa  769    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.971667  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  52.74 
 
 
357 aa  352  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0807  basic membrane lipoprotein  44.7 
 
 
359 aa  305  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0751  basic membrane lipoprotein  43.33 
 
 
364 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191931  hitchhiker  0.00640834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3949  basic membrane lipoprotein  47.22 
 
 
363 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.017082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  42.65 
 
 
356 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  41.23 
 
 
368 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  44.38 
 
 
371 aa  257  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  42.17 
 
 
365 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  43.03 
 
 
358 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04890  uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein  35.98 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651216  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2947  basic membrane lipoprotein  38.75 
 
 
375 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0994  basic membrane lipoprotein  40.88 
 
 
360 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  34.16 
 
 
358 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
356 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  32.84 
 
 
368 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  30.55 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  28.2 
 
 
377 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  30.86 
 
 
366 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  30 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  30.45 
 
 
363 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  30.75 
 
 
361 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  29.71 
 
 
358 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  32.12 
 
 
353 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  30.49 
 
 
363 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  29.41 
 
 
358 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  32.92 
 
 
355 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  29.38 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  29.38 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  29.38 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  29.38 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  30.87 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  29.67 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  29.38 
 
 
355 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  29.38 
 
 
355 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  31.62 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  30.5 
 
 
713 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  30.89 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  31.76 
 
 
361 aa  126  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  31.63 
 
 
356 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  30.83 
 
 
351 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  30 
 
 
356 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  32.85 
 
 
351 aa  123  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 
359 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  28.61 
 
 
359 aa  122  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  25.99 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  28.7 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.66 
 
 
349 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  32.48 
 
 
365 aa  121  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  30.99 
 
 
356 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  27.22 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  30.06 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  28.53 
 
 
354 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  30.7 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  29.08 
 
 
347 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  30.62 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  34.22 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  27.27 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  28.83 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  35.91 
 
 
366 aa  112  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  30.75 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  29.55 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  37.56 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  34.09 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  29.56 
 
 
329 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 
337 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  26.68 
 
 
346 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  27.3 
 
 
354 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  32.11 
 
 
382 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  27.75 
 
 
380 aa  106  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  26.48 
 
 
376 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  28.32 
 
 
334 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  27.7 
 
 
357 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  28.4 
 
 
329 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  28.12 
 
 
340 aa  103  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  28.06 
 
 
338 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  32.77 
 
 
404 aa  103  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  29.36 
 
 
407 aa  102  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  30.33 
 
 
354 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  30.03 
 
 
350 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  31.25 
 
 
358 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  27.79 
 
 
358 aa  99.4  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  30.85 
 
 
403 aa  99.4  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  27.75 
 
 
347 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  27.03 
 
 
389 aa  96.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  31.69 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  26.74 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0960  basic membrane lipoprotein  31.14 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  29.23 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2034  basic membrane lipoprotein  28.74 
 
 
403 aa  93.2  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  29.17 
 
 
322 aa  93.2  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  27.04 
 
 
370 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  27.27 
 
 
331 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  26.73 
 
 
357 aa  90.1  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  27.62 
 
 
328 aa  90.1  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  27.33 
 
 
339 aa  89.7  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  26.83 
 
 
330 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0755  basic membrane lipoprotein  24.93 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>