151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2034 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2034  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 403 aa  803    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  29.97 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  29.72 
 
 		 370 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  30.17 
 
 		 357 aa  127  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  29.12 
 
 		 371 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0755  basic membrane lipoprotein  29.6 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  28.99 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  29.28 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0960  basic membrane lipoprotein  27.69 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  30 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3269  basic membrane lipoprotein  28.25 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000111252  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  31.89 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2259  basic membrane lipoprotein  26.98 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000485708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  29.24 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  27.04 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  28.49 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  28.06 
 
 		 358 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  27.83 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  29.91 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  31.86 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  29.22 
 
 		 713 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  30.42 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  28.42 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  27.8 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  33.96 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0961  basic membrane lipoprotein  27.44 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29.51 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  30.65 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  26.91 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  27.17 
 
 		 358 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  28.02 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  27.76 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  28.65 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  30.59 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  26.72 
 
 		 355 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  26.72 
 
 		 355 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  24.81 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  26.72 
 
 		 355 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  26.72 
 
 		 355 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  26.72 
 
 		 355 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  26.72 
 
 		 355 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  26.72 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  30.04 
 
 		 340 aa  94.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  29.05 
 
 		 355 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  29.52 
 
 		 337 aa  93.2  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  28.36 
 
 		 340 aa  92.8  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  30.98 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  28.42 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  29.31 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 356 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  27.44 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  26.93 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  26.53 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  29.73 
 
 		 329 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  31.46 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  26.02 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  29.9 
 
 		 334 aa  87  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  28.29 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04890  uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein  27.49 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  26.53 
 
 		 356 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  30.39 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  27.04 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  27.48 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  30.04 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  28.51 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  27.37 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  27.78 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  23.94 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  31.2 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  26.57 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  27.6 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  28.27 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  33.99 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  29.86 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  30.25 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  30.04 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  27.69 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  31.12 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  26.45 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  26.15 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  25 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  24.1 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  24.1 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0994  basic membrane lipoprotein  26.3 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3949  basic membrane lipoprotein  25.07 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.017082 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  29.91 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  28.57 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  29.34 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  25.65 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  27.46 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  27.94 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0693  ABC transporter periplasmic protein  30.42 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000138325  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  29.41 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  26.32 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6254  basic membrane lipoprotein  26.1 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  24.56 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  26.69 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  25.13 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>