236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3949 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3949  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 363 aa  736    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.017082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  54.21 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0807  basic membrane lipoprotein  49.72 
 
 		 359 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0751  basic membrane lipoprotein  50.99 
 
 		 364 aa  349  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191931  hitchhiker  0.00640834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  46.76 
 
 		 368 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  47.06 
 
 		 356 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  45.58 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  45.19 
 
 		 371 aa  292  8e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  42.98 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  47.52 
 
 		 358 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0782  basic membrane lipoprotein  47.53 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.971667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04890  uncharacterized ABC-type transport system, periplasmic component/surface lipoprotein  43.42 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651216  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2947  basic membrane lipoprotein  46.5 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0994  basic membrane lipoprotein  48.12 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1020  basic membrane lipoprotein  38.51 
 
 		 368 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  31.97 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  33.44 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  32.76 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  34.3 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  33.98 
 
 		 356 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  33.61 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  33.8 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  31.25 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  29.26 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  32.62 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  31.21 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  31.45 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  29.28 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  36 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  29.22 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  30.03 
 
 		 359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  30.03 
 
 		 359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  31.14 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  29.57 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  29.57 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  29.57 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  29.57 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  29.57 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  29.57 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  30.9 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  30.98 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  29.57 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  31.29 
 
 		 713 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  29.57 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  31.18 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  36.16 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  29.33 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  31.76 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  29.68 
 
 		 358 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  29.11 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  28.88 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  28.03 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  31.33 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  28.98 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  29.74 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  31.41 
 
 		 342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  28.13 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  28.21 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  28.48 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  29.86 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  28.83 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  28.62 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  32.25 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  29.41 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  27.72 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  27.45 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  30.13 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  30.28 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  25.56 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  29.82 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  30.25 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  28.89 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  26.32 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  27.75 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  27.17 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  26.39 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  29.21 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  27.33 
 
 		 331 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.65 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  27.65 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  27.1 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  30.53 
 
 		 341 aa  100  6e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  28.3 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  28.03 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  26.26 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  28.73 
 
 		 347 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  29.02 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  28.16 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  27.27 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  28.48 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  29.94 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  27.16 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  26.19 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  25.33 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2121  basic membrane lipoprotein  29.3 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2034  basic membrane lipoprotein  26.22 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  28.94 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  26.04 
 
 		 356 aa  92  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>