238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2720 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2720  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 333 aa  680    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  29.9 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  30.25 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  27.8 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  28.03 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3919  basic membrane lipoprotein  29.04 
 
 		 566 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.308906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  29.5 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  27.09 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  30.94 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  26.21 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  30.67 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  33.65 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  26.09 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  26.21 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  29.41 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  29.81 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  31.12 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  28.27 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.22 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  31.22 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  30.66 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  28.4 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  29.72 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  33.8 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  33.33 
 
 		 356 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  31.02 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  27.98 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  30.2 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  27.98 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  30.65 
 
 		 340 aa  102  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  29.63 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  30.19 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  26.88 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  28.71 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  28.71 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  29.41 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  29.41 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  29.41 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  29.41 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  29.41 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  29.9 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  29.9 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  26.61 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  27.84 
 
 		 347 aa  95.9  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  30.7 
 
 		 365 aa  95.9  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  28.04 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0635  basic membrane lipoprotein  27.54 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  27.24 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  28.7 
 
 		 377 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  28.71 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  28.44 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  28.92 
 
 		 361 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  30.67 
 
 		 366 aa  92.4  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  26.09 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  26.94 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  29.29 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  28.12 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  31.79 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  28.47 
 
 		 357 aa  89.4  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  29.48 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  26.74 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  27.51 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  26.42 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  25.95 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  24.76 
 
 		 346 aa  85.9  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  26.22 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  34.78 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  28.19 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  27.84 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  25.96 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  28.3 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  27.4 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  25.63 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  22.02 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  27.27 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  26.03 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  26.61 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  26.4 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  28.12 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  26.61 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6254  basic membrane lipoprotein  25.56 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  22.54 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0386  basic membrane protein C (bmpC)  29.68 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  27.23 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  31.54 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  24.6 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  28.49 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  27.03 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  26.87 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  23.03 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2598  basic membrane lipoprotein  25.28 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  25.68 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  30.3 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  25 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  24.61 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  30.72 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  24.74 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>