More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1582 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1582  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000305308 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1448  ABC transporter related  75.59 
 
 
254 aa  384  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1641  ABC transporter related  72.44 
 
 
254 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1011  ABC transporter related  75.98 
 
 
254 aa  364  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000135392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  46.49 
 
 
298 aa  208  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0302  ABC transporter related  48.44 
 
 
289 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.353598 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  47.73 
 
 
242 aa  202  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  42.19 
 
 
244 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  47.96 
 
 
224 aa  192  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.93 
 
 
251 aa  192  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  42.06 
 
 
249 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.87 
 
 
248 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.47 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
319 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.47 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.66 
 
 
238 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.62 
 
 
225 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.62 
 
 
225 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.34 
 
 
230 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
230 aa  185  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  46.35 
 
 
234 aa  184  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  43.38 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  42.41 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  45 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  42.73 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  45.62 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  43.89 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  42.4 
 
 
252 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  45.81 
 
 
218 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  43.52 
 
 
236 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.91 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45.62 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  42.13 
 
 
231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  41.41 
 
 
251 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
286 aa  181  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
233 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  47.53 
 
 
227 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
334 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 
221 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  44.74 
 
 
237 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  43.98 
 
 
242 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  42.86 
 
 
255 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  47.03 
 
 
237 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  45 
 
 
238 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  42.06 
 
 
249 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  42.86 
 
 
253 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  43.18 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  47.37 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  44.24 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  42.86 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  44.24 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  47.37 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.06 
 
 
226 aa  179  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  43.17 
 
 
232 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  47.3 
 
 
228 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 
408 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  44.24 
 
 
240 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 
225 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  47.53 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  43.23 
 
 
255 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  40.28 
 
 
604 aa  178  7e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.78 
 
 
234 aa  178  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  44.24 
 
 
239 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  42.92 
 
 
232 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  42.79 
 
 
235 aa  178  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  44.6 
 
 
244 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
252 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.91 
 
 
238 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  40 
 
 
248 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  44.24 
 
 
229 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 
231 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  38.93 
 
 
266 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  40.81 
 
 
231 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  42.98 
 
 
228 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  41.94 
 
 
230 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  42.4 
 
 
256 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  43.98 
 
 
239 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  45.29 
 
 
234 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  40.99 
 
 
229 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  43.05 
 
 
280 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  39.21 
 
 
247 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  43.98 
 
 
231 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
237 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
235 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  43.52 
 
 
222 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
229 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  42.99 
 
 
225 aa  176  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1427  ABC transporter related  41.67 
 
 
241 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.09 
 
 
240 aa  175  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1950  ABC transporter related  43.69 
 
 
238 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458128  normal  0.0230529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
222 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
238 aa  175  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  46.85 
 
 
231 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.6 
 
 
280 aa  174  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  45.29 
 
 
233 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  43.18 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.72 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>