More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1641 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1641  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  500  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1448  ABC transporter related  80.31 
 
 		 254 aa  403  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1011  ABC transporter related  79.13 
 
 		 254 aa  377  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000135392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1582  ABC transporter related  72.44 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000305308 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0302  ABC transporter related  51.34 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.353598 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  44.68 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.64 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  45.91 
 
 		 233 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  41.35 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  44.5 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  42.67 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  39.83 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  45 
 
 		 229 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.95 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  42.27 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  43.58 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  45 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.31 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  41.85 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  45.41 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  45.41 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  41.99 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  46.82 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  42.27 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.74 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  41.63 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 246 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  40.81 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  44.55 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  45.5 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  40.91 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  44.59 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  40.37 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  40.37 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 264 aa  181  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  43.84 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  43.38 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3481  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  42.99 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  42.41 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  44.69 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  39.63 
 
 		 604 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  39.92 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  46.49 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  44.2 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  39.37 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  39.91 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.28 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  46.49 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  38.43 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 408 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  42.92 
 
 		 217 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  40.37 
 
 		 242 aa  178  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  38.96 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  42.54 
 
 		 236 aa  178  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  43.38 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4972  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4985  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4565  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124496  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  43.18 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0279  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  44.34 
 
 		 707 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4956  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1950  ABC transporter related  41.07 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458128  normal  0.0230529 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  41.18 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1417  ABC transporter related  42.34 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.153222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  39.46 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4723  ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  40.37 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  39.82 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  42.73 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  40.18 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  40.37 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  40.72 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.27 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  41.18 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  38.93 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  41.86 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4946  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  41.28 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>