109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2702 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2702  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  763    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3050  hypothetical protein  98.4 
 
 		 376 aa  755    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3085  hypothetical protein  92.55 
 
 		 376 aa  712    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2997  porin  82.85 
 
 		 379 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5897  outer membrane protein (porin)-like protein  31.87 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0466663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3601  porin  31.51 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4766  porin  31.51 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5517  porin  31.51 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0949  outer membrane protein (porin)-like  31.13 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  27.25 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  27.32 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  26.42 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  27.25 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  26.67 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  26.1 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  26.96 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  26.96 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  24.31 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  26.82 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1963  porin  25.07 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.513284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  24.13 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  29.81 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  29.81 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  24.28 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  29.33 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  24.46 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  24.28 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  25.53 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  29.72 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  24.15 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  23.88 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  24.54 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  29.58 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  29.72 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  28.3 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  24.46 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  23.7 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  23.7 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  26.86 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  24.29 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  23.28 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  26.77 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  24.77 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  24.23 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  25.38 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  31.93 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  23.82 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  28.37 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  22.69 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  28.37 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  27.5 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  26.29 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  27.02 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  26.81 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  26.38 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  29.41 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  27.84 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  28.05 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  24.86 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  26.03 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  25.54 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  30.06 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  27.24 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  27.24 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  29.09 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  27.24 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  29.38 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  26.13 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  25.2 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  25.2 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  25.84 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  23.96 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  25.2 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  27.63 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  24.8 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  28.71 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  28.7 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  27.75 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  24.8 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  27.27 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  22.74 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  27.27 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  26.21 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  24.81 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  21.93 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  27.04 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  27.27 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  25.1 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  27.37 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  24.63 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  27.97 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  24.64 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  25.63 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  25.71 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  25.19 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  27.27 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  22.65 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  28.4 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  23.68 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  27.45 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>