More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1235 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1235  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  100 
 
 
322 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.747761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.65 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.69 
 
 
350 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
333 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  35.23 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.6 
 
 
332 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.56 
 
 
331 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.33 
 
 
325 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  33.97 
 
 
329 aa  159  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  30.88 
 
 
338 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.94 
 
 
326 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.92 
 
 
330 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.68 
 
 
340 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  30.53 
 
 
338 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.21 
 
 
331 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.53 
 
 
353 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.7 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  34.47 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.84 
 
 
356 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.96 
 
 
331 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.04 
 
 
337 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  32.14 
 
 
331 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  34.59 
 
 
331 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.23 
 
 
344 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.08 
 
 
333 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.08 
 
 
333 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.75 
 
 
327 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2092  polysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.58 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.14 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  34.09 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.39 
 
 
339 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  33.59 
 
 
332 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.76 
 
 
337 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  34.47 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.32 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.83 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  33.69 
 
 
336 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.46 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.64 
 
 
331 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.99 
 
 
344 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  30.53 
 
 
333 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.69 
 
 
350 aa  143  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.75 
 
 
327 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.3 
 
 
333 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.51 
 
 
336 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
334 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.05 
 
 
336 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.64 
 
 
329 aa  142  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.73 
 
 
340 aa  142  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.3 
 
 
328 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.83 
 
 
331 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  32.71 
 
 
332 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.83 
 
 
331 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.1 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  30.61 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  33.69 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.91 
 
 
333 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.58 
 
 
357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  32.95 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  32.95 
 
 
334 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  29.57 
 
 
328 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.26 
 
 
340 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.26 
 
 
340 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.01 
 
 
346 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.74 
 
 
338 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.97 
 
 
340 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.32 
 
 
332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.75 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.04 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4310  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.77 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.6 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.36 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27 
 
 
355 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  30.09 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.88 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.49 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  32.26 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  29.23 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.43 
 
 
345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.01 
 
 
342 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.03 
 
 
345 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.67 
 
 
345 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.01 
 
 
342 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.22 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.97 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.79 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.33 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18620  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.07 
 
 
342 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436748  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.37 
 
 
341 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
336 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.23 
 
 
335 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.17 
 
 
404 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.83 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0761  UDP-glucose 4-epimerase  30.43 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.98 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.38 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.21 
 
 
680 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.83 
 
 
614 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1258  UDP-GlcNAc C4,6 dehydratase  28.88 
 
 
587 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.62797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>