More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0147 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
340 aa  691    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  61.61 
 
 
341 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.24 
 
 
344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.94 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.09 
 
 
330 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.09 
 
 
332 aa  305  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.43 
 
 
341 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.37 
 
 
337 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.71 
 
 
355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.98 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.21 
 
 
404 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.82 
 
 
329 aa  262  6e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.23 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.44 
 
 
350 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.47 
 
 
325 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.23 
 
 
356 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.36 
 
 
342 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.49 
 
 
333 aa  248  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.49 
 
 
333 aa  248  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  41.72 
 
 
327 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  42.86 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  41.84 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  38.18 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  42.28 
 
 
333 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.01 
 
 
335 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  41.16 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  37.58 
 
 
328 aa  242  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  38.26 
 
 
334 aa  242  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.18 
 
 
328 aa  241  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  39.88 
 
 
331 aa  241  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  39.88 
 
 
331 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  38.55 
 
 
334 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  41.5 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.45 
 
 
331 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.45 
 
 
331 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.2 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.53 
 
 
327 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.71 
 
 
331 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.74 
 
 
332 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.81 
 
 
333 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.54 
 
 
332 aa  236  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  39.1 
 
 
332 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  41.78 
 
 
328 aa  236  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
333 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.21 
 
 
353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.5 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.1 
 
 
331 aa  232  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.16 
 
 
333 aa  233  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.38 
 
 
339 aa  232  9e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.29 
 
 
331 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  40.14 
 
 
329 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.48 
 
 
331 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.62 
 
 
344 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.39 
 
 
680 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.41 
 
 
332 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.65 
 
 
357 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.57 
 
 
333 aa  225  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.18 
 
 
607 aa  225  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  39.93 
 
 
338 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.28 
 
 
340 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  38.92 
 
 
338 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.12 
 
 
355 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.53 
 
 
337 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.55 
 
 
333 aa  222  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.61 
 
 
344 aa  222  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.23 
 
 
613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.39 
 
 
344 aa  218  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.84 
 
 
345 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.05 
 
 
336 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.1 
 
 
336 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.91 
 
 
338 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  40.18 
 
 
635 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  35.52 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.86 
 
 
340 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.58 
 
 
342 aa  215  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.58 
 
 
342 aa  215  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.26 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  35.1 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.87 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  44.75 
 
 
649 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.73 
 
 
348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.2 
 
 
612 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.2 
 
 
612 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.22 
 
 
340 aa  212  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  38.34 
 
 
345 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 
630 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.14 
 
 
340 aa  212  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  45.85 
 
 
615 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1680  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.49 
 
 
642 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981888  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  36.5 
 
 
336 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.67 
 
 
614 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 
627 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.67 
 
 
627 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 
627 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 
627 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.72 
 
 
617 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.54 
 
 
341 aa  210  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 
627 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 
628 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  44.37 
 
 
644 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>