More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1471 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
341 aa  699    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  61.61 
 
 
340 aa  418  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.2 
 
 
330 aa  338  8e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.66 
 
 
343 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.96 
 
 
344 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.32 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.59 
 
 
355 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.1 
 
 
337 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.28 
 
 
335 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.39 
 
 
404 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.26 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.25 
 
 
341 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  41.57 
 
 
331 aa  259  6e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  43.48 
 
 
335 aa  257  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.48 
 
 
326 aa  256  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.57 
 
 
350 aa  252  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.57 
 
 
331 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.47 
 
 
325 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.89 
 
 
331 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  40.18 
 
 
329 aa  250  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  43.73 
 
 
331 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  44.11 
 
 
334 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  43.43 
 
 
331 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  44.56 
 
 
334 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40 
 
 
328 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  43.77 
 
 
334 aa  249  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  39.88 
 
 
328 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.96 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.07 
 
 
333 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.07 
 
 
333 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.43 
 
 
331 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.43 
 
 
331 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  43.73 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.42 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  38.97 
 
 
328 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.62 
 
 
356 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.95 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  41.75 
 
 
333 aa  243  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.41 
 
 
340 aa  242  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  41.41 
 
 
338 aa  242  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.05 
 
 
332 aa  241  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.1 
 
 
331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.12 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  40.94 
 
 
328 aa  239  4e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.07 
 
 
342 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.25 
 
 
327 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.72 
 
 
353 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.42 
 
 
333 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  38.24 
 
 
332 aa  235  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.91 
 
 
333 aa  235  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.41 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.58 
 
 
607 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.17 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  42.23 
 
 
333 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.47 
 
 
333 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  40.46 
 
 
338 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.84 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.5 
 
 
342 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.5 
 
 
342 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.02 
 
 
344 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.36 
 
 
333 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.37 
 
 
357 aa  229  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.24 
 
 
339 aa  229  6e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.73 
 
 
344 aa  229  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.13 
 
 
337 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  45.64 
 
 
649 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  40.68 
 
 
635 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.12 
 
 
336 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2092  polysaccharide biosynthesis protein  39.46 
 
 
337 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.19 
 
 
613 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.05 
 
 
355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.64 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.91 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.49 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.66 
 
 
332 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.43 
 
 
680 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.85 
 
 
340 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.33 
 
 
614 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.03 
 
 
646 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.94 
 
 
345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.41 
 
 
653 aa  215  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  38.43 
 
 
336 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.3 
 
 
350 aa  215  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.61 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0250  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.53 
 
 
665 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0234353 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  44.84 
 
 
613 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.5 
 
 
336 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  43.05 
 
 
647 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  35.54 
 
 
344 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.75 
 
 
638 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.14 
 
 
614 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.43 
 
 
341 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.9 
 
 
635 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  35.56 
 
 
345 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.8 
 
 
613 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 
336 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.64 
 
 
344 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.5 
 
 
336 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.6 
 
 
642 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.1 
 
 
336 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>