More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2184 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 404 aa  825    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.26 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.94 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.92 
 
 		 330 aa  292  7e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.63 
 
 		 332 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.75 
 
 		 341 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.21 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.21 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.15 
 
 		 337 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 		 335 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.86 
 
 		 341 aa  259  7e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.19 
 
 		 328 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  41.24 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.26 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  41.24 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.32 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.1 
 
 		 357 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.64 
 
 		 613 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.61 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.61 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.07 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.5 
 
 		 344 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.19 
 
 		 635 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.67 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.81 
 
 		 614 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  41.72 
 
 		 604 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  37.95 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0328  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.85 
 
 		 613 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0440695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  36.79 
 
 		 329 aa  216  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  36.95 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  40.14 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.04 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  41.38 
 
 		 603 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.44 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.04 
 
 		 336 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.81 
 
 		 629 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  45.07 
 
 		 613 aa  212  7e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.5 
 
 		 336 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.26 
 
 		 611 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.26 
 
 		 607 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  36.61 
 
 		 331 aa  212  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14281  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  40.48 
 
 		 629 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.99 
 
 		 612 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.04 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.46 
 
 		 338 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.13 
 
 		 345 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.87 
 
 		 609 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.11 
 
 		 350 aa  210  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.17 
 
 		 627 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.32 
 
 		 627 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.03 
 
 		 650 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.54 
 
 		 344 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.3 
 
 		 333 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.14 
 
 		 628 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 		 333 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  41.98 
 
 		 649 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.85 
 
 		 630 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.3 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.68 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.41 
 
 		 613 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.32 
 
 		 627 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.32 
 
 		 627 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.32 
 
 		 627 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.13 
 
 		 680 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.84 
 
 		 344 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.02 
 
 		 653 aa  207  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3936  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42 
 
 		 670 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.218283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.52 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.74 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.38 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  41.72 
 
 		 635 aa  206  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.59 
 
 		 638 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3816  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.11 
 
 		 645 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  37.7 
 
 		 332 aa  206  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.66 
 
 		 607 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.6 
 
 		 652 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.3 
 
 		 327 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  38.32 
 
 		 656 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  38.51 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.01 
 
 		 628 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.19 
 
 		 646 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.79 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.76 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.3 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.96 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.3 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.82 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  36.61 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1542  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.58 
 
 		 480 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.26 
 
 		 669 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.67 
 
 		 336 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  41.79 
 
 		 647 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.64 
 
 		 646 aa  203  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.03 
 
 		 652 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4568  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.84 
 
 		 731 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.730165  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  36.63 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  36.61 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.54 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.49 
 
 		 356 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>