More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0117 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
335 aa  684    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.4 
 
 
344 aa  273  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.29 
 
 
343 aa  269  5e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.95 
 
 
330 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.02 
 
 
341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.99 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.35 
 
 
337 aa  248  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.08 
 
 
335 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.01 
 
 
340 aa  243  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.86 
 
 
338 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.58 
 
 
346 aa  232  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.46 
 
 
353 aa  229  6e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.51 
 
 
355 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
336 aa  228  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.96 
 
 
341 aa  228  9e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.01 
 
 
344 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  41.75 
 
 
328 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.2 
 
 
336 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  40.86 
 
 
336 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.87 
 
 
337 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  42.11 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.32 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.11 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.54 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.21 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.66 
 
 
350 aa  219  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.53 
 
 
350 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.24 
 
 
326 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.64 
 
 
325 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.74 
 
 
350 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.2 
 
 
345 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.54 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.29 
 
 
345 aa  215  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.41 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.74 
 
 
342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.74 
 
 
342 aa  212  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.74 
 
 
342 aa  212  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  35.56 
 
 
344 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.24 
 
 
329 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.92 
 
 
344 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.38 
 
 
357 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.58 
 
 
350 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.86 
 
 
340 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.05 
 
 
336 aa  206  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.31 
 
 
348 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.54 
 
 
348 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.8 
 
 
333 aa  205  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  37.78 
 
 
345 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.52 
 
 
331 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.52 
 
 
331 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4310  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.24 
 
 
344 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.8 
 
 
331 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.86 
 
 
331 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.16 
 
 
612 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40 
 
 
680 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.16 
 
 
612 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18620  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.63 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436748  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.25 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  39.86 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  39.52 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.38 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  39.86 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  36.95 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.8 
 
 
341 aa  200  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  39.18 
 
 
331 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.59 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.83 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.19 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.41 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.49 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  39.52 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  38.7 
 
 
338 aa  196  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.83 
 
 
332 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.93 
 
 
333 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  35.61 
 
 
635 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 
333 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.8 
 
 
333 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.61 
 
 
336 aa  192  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.41 
 
 
643 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0714  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.89 
 
 
495 aa  192  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00136687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.67 
 
 
344 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.93 
 
 
650 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  40.85 
 
 
615 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.49 
 
 
333 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.49 
 
 
333 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.28 
 
 
648 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.52 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.64 
 
 
607 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.12 
 
 
620 aa  189  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  42.76 
 
 
604 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  37.11 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.83 
 
 
355 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.21 
 
 
652 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  42.76 
 
 
603 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  36.79 
 
 
334 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  37.46 
 
 
333 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  37.88 
 
 
338 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  36.64 
 
 
332 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0713  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.5 
 
 
641 aa  187  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.46 
 
 
332 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>