More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3090 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 
326 aa  682    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  61.51 
 
 
325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.61 
 
 
350 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.35 
 
 
344 aa  364  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  53.05 
 
 
329 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.54 
 
 
327 aa  358  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  53.87 
 
 
332 aa  354  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  54.86 
 
 
332 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  51.07 
 
 
335 aa  353  2e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  52.6 
 
 
331 aa  353  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  52.28 
 
 
328 aa  352  7e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  51.38 
 
 
333 aa  351  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.42 
 
 
331 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.58 
 
 
332 aa  349  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.11 
 
 
332 aa  349  5e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.5 
 
 
340 aa  348  7e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  51.22 
 
 
334 aa  348  7e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  51.52 
 
 
334 aa  348  8e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  50.77 
 
 
327 aa  347  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  51.52 
 
 
334 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.35 
 
 
331 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.93 
 
 
332 aa  345  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.15 
 
 
333 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.15 
 
 
333 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.3 
 
 
344 aa  343  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  52.34 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.37 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.3 
 
 
332 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  51.06 
 
 
331 aa  338  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.94 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.35 
 
 
331 aa  338  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.57 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.57 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.8 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.61 
 
 
331 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.22 
 
 
333 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  50.31 
 
 
342 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.85 
 
 
357 aa  329  4e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  49.54 
 
 
338 aa  324  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  50.46 
 
 
356 aa  318  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.5 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  47.62 
 
 
333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2092  polysaccharide biosynthesis protein  47.73 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  51.23 
 
 
339 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  46.48 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.34 
 
 
337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00862014 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  48 
 
 
336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.87 
 
 
340 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.48 
 
 
329 aa  292  5e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.88 
 
 
343 aa  285  9e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.67 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.44 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.04 
 
 
332 aa  279  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.96 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.75 
 
 
328 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  44.75 
 
 
328 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  45.06 
 
 
328 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.52 
 
 
337 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.23 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  43.56 
 
 
336 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.39 
 
 
344 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  40.79 
 
 
344 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.6 
 
 
336 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.6 
 
 
346 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.94 
 
 
350 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.96 
 
 
341 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.9 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.73 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.3 
 
 
336 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.8 
 
 
342 aa  243  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.8 
 
 
342 aa  243  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.36 
 
 
344 aa  242  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.12 
 
 
336 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.48 
 
 
341 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.82 
 
 
348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.17 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.21 
 
 
338 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  45.04 
 
 
336 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.91 
 
 
345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.05 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.44 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  40.06 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.57 
 
 
348 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.25 
 
 
340 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.93 
 
 
340 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.26 
 
 
404 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  43.57 
 
 
345 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.39 
 
 
345 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.39 
 
 
355 aa  225  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.48 
 
 
340 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.34 
 
 
355 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4310  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.49 
 
 
344 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.24 
 
 
335 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18620  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  43.88 
 
 
342 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436748  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.04 
 
 
353 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0761  UDP-glucose 4-epimerase  40.45 
 
 
348 aa  205  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.24 
 
 
613 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.15 
 
 
646 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.41 
 
 
607 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.92 
 
 
680 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>