More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0609 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  100 
 
 		 333 aa  696    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  73.87 
 
 		 333 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  72.81 
 
 		 331 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  71.77 
 
 		 333 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  71.77 
 
 		 333 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  72.21 
 
 		 331 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  71.34 
 
 		 332 aa  511  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  71.6 
 
 		 331 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  72.92 
 
 		 332 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  71.3 
 
 		 331 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  71.95 
 
 		 331 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  71.3 
 
 		 331 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  71.91 
 
 		 331 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  71.6 
 
 		 331 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  67.47 
 
 		 333 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  68.18 
 
 		 334 aa  481  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  68.79 
 
 		 334 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  68.18 
 
 		 335 aa  481  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  68.18 
 
 		 334 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  67.28 
 
 		 333 aa  478  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.65 
 
 		 333 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  67.38 
 
 		 333 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  67.71 
 
 		 333 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  66.98 
 
 		 328 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  66.36 
 
 		 329 aa  462  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  65.85 
 
 		 332 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  66.05 
 
 		 331 aa  464  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  59.1 
 
 		 344 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.91 
 
 		 344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  58.01 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.02 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.93 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  55.52 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  58.36 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  56.44 
 
 		 327 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.27 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  58.33 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  55.72 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.41 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.68 
 
 		 340 aa  360  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  52.13 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2092  polysaccharide biosynthesis protein  55.02 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.52 
 
 		 332 aa  350  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  51.38 
 
 		 326 aa  351  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.19 
 
 		 325 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  54.41 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.91 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  54.27 
 
 		 339 aa  339  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.81 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.35 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.3 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.49 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.69 
 
 		 335 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.34 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  45 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  45 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.84 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  46.64 
 
 		 336 aa  245  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.36 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.28 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.09 
 
 		 350 aa  242  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.23 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.3 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.3 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  42.73 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  41.27 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  38.37 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.27 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.88 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.27 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.69 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 		 336 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  44.81 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.84 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.82 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.61 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.55 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.75 
 
 		 341 aa  229  6e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.7 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.48 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  39.7 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.19 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4310  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.05 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.06 
 
 		 340 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.39 
 
 		 340 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.42 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.21 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.13 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.84 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.44 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.76 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18620  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.93 
 
 		 342 aa  205  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.18 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.36 
 
 		 404 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0761  UDP-glucose 4-epimerase  40.28 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.46 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.04 
 
 		 607 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.24 
 
 		 680 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.64 
 
 		 614 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  39.19 
 
 		 635 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>