More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1258 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1263  general glycosylation pathway protein  77.3 
 
 
590 aa  899    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1138  general glycosylation pathway protein  77.3 
 
 
590 aa  898    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.550891  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0949  general glycosylation pathway protein  58.78 
 
 
597 aa  676    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.266256  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1202  putative epimerase/dehydratase WbiI  59.35 
 
 
593 aa  697    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0447  FO synthase subunit 2 (7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase subunit 2)  59.86 
 
 
593 aa  696    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1258  UDP-GlcNAc C4,6 dehydratase  100 
 
 
587 aa  1187    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.62797  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1354  putative epimerase/dehydratase WbiI  56.78 
 
 
595 aa  666    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1769  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.48 
 
 
577 aa  423  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0760  general glycosylation pathway protein  63.1 
 
 
341 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.574123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.87 
 
 
629 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.09 
 
 
614 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.8 
 
 
612 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.18 
 
 
612 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  35.93 
 
 
604 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.44 
 
 
612 aa  349  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  36.27 
 
 
603 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
617 aa  347  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.49 
 
 
626 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.11 
 
 
642 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1805  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.69 
 
 
688 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  36.46 
 
 
649 aa  340  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.4 
 
 
613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.56 
 
 
647 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.99 
 
 
644 aa  336  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  35.14 
 
 
635 aa  336  7.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.96 
 
 
635 aa  336  9e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.94 
 
 
647 aa  334  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.87 
 
 
637 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  35.43 
 
 
614 aa  333  6e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.55 
 
 
669 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.48 
 
 
609 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4002  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.51 
 
 
615 aa  330  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10733  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.24 
 
 
653 aa  326  6e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.31 
 
 
623 aa  326  7e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.12 
 
 
648 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3636  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.09 
 
 
664 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.56 
 
 
607 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  34.61 
 
 
637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  34.61 
 
 
637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  34.61 
 
 
637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  34.09 
 
 
647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.61 
 
 
637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  34.61 
 
 
637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.61 
 
 
637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  34.61 
 
 
637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3456  nucleotide sugar epimerase/dehydratase  36.24 
 
 
635 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360155  normal  0.018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.21 
 
 
627 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.05 
 
 
625 aa  321  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.26 
 
 
680 aa  320  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.89 
 
 
627 aa  320  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1131  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.93 
 
 
671 aa  320  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00726608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.47 
 
 
643 aa  320  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.52 
 
 
656 aa  319  9e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.12 
 
 
676 aa  319  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1986  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  32.97 
 
 
670 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  34.44 
 
 
656 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1756  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  34.52 
 
 
664 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.7 
 
 
646 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3389  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.99 
 
 
630 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.26 
 
 
682 aa  317  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3936  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.87 
 
 
670 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.218283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3273  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.88 
 
 
628 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.72 
 
 
628 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4051  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.39 
 
 
664 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8742  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.33 
 
 
628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1585  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.98 
 
 
653 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216403  normal  0.968528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.61 
 
 
610 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2611  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.92 
 
 
653 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116735  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14281  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  38.7 
 
 
629 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.44 
 
 
647 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23470  nucleotide sugar epimerase/dehydratase WbpM  33.61 
 
 
665 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000136897  hitchhiker  0.00347476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0328  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.34 
 
 
613 aa  313  6.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0440695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.43 
 
 
633 aa  312  9e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.83 
 
 
630 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1379  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.33 
 
 
675 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.136886  hitchhiker  0.000537083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  34.72 
 
 
625 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.56 
 
 
650 aa  309  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.44 
 
 
627 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.44 
 
 
627 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.44 
 
 
627 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  33.11 
 
 
615 aa  309  9e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.16 
 
 
652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.69 
 
 
611 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0813  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.82 
 
 
659 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32823  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.69 
 
 
607 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  35.28 
 
 
646 aa  306  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2876  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.77 
 
 
646 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.75 
 
 
629 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3816  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.78 
 
 
645 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.96 
 
 
646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4766  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.15 
 
 
643 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0559289  normal  0.121979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.85 
 
 
664 aa  304  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3126  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.33 
 
 
633 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503601  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.15 
 
 
616 aa  303  6.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18500  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.01 
 
 
626 aa  303  6.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.981447 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.72 
 
 
634 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.883555  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.48 
 
 
614 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.89 
 
 
649 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2638  mannosyl-transferase  35.1 
 
 
621 aa  301  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>