More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33547 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_33547  predicted protein  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  30.09 
 
 		 233 aa  95.5  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  29.41 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  36.02 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  32.45 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  30.48 
 
 		 234 aa  92.8  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  29.05 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  30.89 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  32.09 
 
 		 232 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  28.7 
 
 		 234 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  29.81 
 
 		 239 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  33.71 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  31.61 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  31.38 
 
 		 233 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0440  ribosomal protein L1  28.19 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  29.09 
 
 		 232 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  32.62 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  27.14 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08225  mitochondrial large ribosomal subunit protein L1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03570)  29.47 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724481  normal  0.512269 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  30.05 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2470  50S ribosomal protein L1  31.35 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538849  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  32.62 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  29.26 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  33.14 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  29.9 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  30.37 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  31.55 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  30.11 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  27.03 
 
 		 234 aa  86.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  26.11 
 
 		 237 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  28.34 
 
 		 235 aa  85.9  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  28.57 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  28.57 
 
 		 233 aa  85.9  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  27.78 
 
 		 233 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  30.48 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  31.91 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  29.24 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  29.41 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0633  50S ribosomal protein L1  30.65 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.846201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  30.48 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  31.18 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  26.21 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  31.02 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  30.11 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  27.73 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  27.35 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  25.71 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  29.76 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  29.57 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  29.57 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2553  50S ribosomal protein L1  29.61 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  28.8 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  28.71 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  27.27 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0358  50S ribosomal protein L1  30.85 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  24.05 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14915  predicted protein  29.38 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  33.16 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1044  ribosomal protein L1  32.45 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.114234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  27.11 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  32.1 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  31.02 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  30.32 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  32.62 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  27.43 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  30.16 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  27.04 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  26.79 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  28.34 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  31.55 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  30.98 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  26.54 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  31.02 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  29.78 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  30.98 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  30.98 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1570  50S ribosomal protein L1  28.88 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0205  50S ribosomal protein L1  30.43 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  30 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  30.98 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02791  50S ribosomal protein L1  28.88 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.475982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  26.91 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1019  50S ribosomal protein L1  26.5 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726287 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  27.19 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  27.19 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  28.26 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02231  50S ribosomal protein L1  30.43 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  27.19 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  28.8 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02211  50S ribosomal protein L1  30.43 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  30.11 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02321  50S ribosomal protein L1  30.43 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  26.6 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  22.46 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  22.46 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  25.88 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  28.57 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  27.81 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  28.57 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27781  50S ribosomal protein L1  28.8 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>