More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1044 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1044  ribosomal protein L1  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.114234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  55.07 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.5 
 
 		 230 aa  257  8e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  53.25 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 231 aa  255  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  52.02 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  53.51 
 
 		 231 aa  254  6e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  53.95 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  52.02 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  50.67 
 
 		 235 aa  251  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  56.14 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  52.4 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 235 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  49.36 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  51.54 
 
 		 230 aa  248  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  51.54 
 
 		 230 aa  248  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  54.26 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  52.38 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  50 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  51.32 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  53.36 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  51.12 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 233 aa  244  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  53.81 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 238 aa  241  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  53.57 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  53.57 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  53.57 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  53.68 
 
 		 237 aa  241  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  47.23 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  49.79 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  52.05 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  51.6 
 
 		 229 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  51.12 
 
 		 225 aa  237  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  56.14 
 
 		 230 aa  237  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  237  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  49.13 
 
 		 233 aa  237  9e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  51.3 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  49.13 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  52.61 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  49.34 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0255  50S ribosomal protein L1  50.21 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000222102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  48.5 
 
 		 242 aa  235  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  52.19 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  47.81 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  51.1 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 239 aa  234  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  51.98 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  50.88 
 
 		 232 aa  234  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  49.13 
 
 		 232 aa  234  9e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  50.66 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  47.58 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0384  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0359  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  46.9 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  51.54 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  48.7 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  47.58 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  47.58 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 229 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  52.36 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  51.85 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  51.85 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  50 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  50 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>