More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2264 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2264  type II secretion system protein E  100 
 
 
769 aa  1567    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  47.88 
 
 
676 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  46.5 
 
 
673 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  46.75 
 
 
670 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  46.34 
 
 
673 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  45.65 
 
 
670 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  45.29 
 
 
668 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  41.4 
 
 
666 aa  505  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  39.52 
 
 
723 aa  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1299  General secretory system II protein E domain protein  36.86 
 
 
747 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1268  General secretory system II protein E domain protein  36.42 
 
 
747 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  36.16 
 
 
638 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
557 aa  279  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  30.99 
 
 
599 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  33.91 
 
 
871 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  32.43 
 
 
599 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  33.52 
 
 
558 aa  275  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  30.99 
 
 
599 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  29.84 
 
 
553 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  37.78 
 
 
594 aa  271  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  29.3 
 
 
787 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06911  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like protein  37.53 
 
 
568 aa  269  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  30.03 
 
 
557 aa  269  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.7 
 
 
571 aa  268  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  30.89 
 
 
603 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  30.2 
 
 
556 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  31.4 
 
 
558 aa  264  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  30.13 
 
 
568 aa  263  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  33.78 
 
 
521 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  30.36 
 
 
552 aa  262  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.11 
 
 
571 aa  261  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  29.8 
 
 
573 aa  260  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  31.48 
 
 
500 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  31.8 
 
 
564 aa  259  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  30.51 
 
 
561 aa  257  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  28.83 
 
 
561 aa  257  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.48 
 
 
568 aa  256  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.48 
 
 
568 aa  256  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  30.11 
 
 
570 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  31.28 
 
 
558 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  30.81 
 
 
568 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  36.75 
 
 
560 aa  255  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  28.76 
 
 
562 aa  253  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  29.06 
 
 
553 aa  253  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  30.21 
 
 
570 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  28.48 
 
 
566 aa  252  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.52 
 
 
578 aa  252  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  28.43 
 
 
570 aa  251  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  30.76 
 
 
520 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  34.89 
 
 
578 aa  251  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.11 
 
 
568 aa  251  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  34.84 
 
 
514 aa  251  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  28.76 
 
 
553 aa  249  9e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  34.47 
 
 
499 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  30.11 
 
 
577 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  30.79 
 
 
567 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.46 
 
 
568 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  28.45 
 
 
560 aa  249  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  35.2 
 
 
518 aa  249  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  29.15 
 
 
571 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  28.55 
 
 
565 aa  248  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  36.53 
 
 
563 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  34.66 
 
 
514 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  30.27 
 
 
553 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  35.56 
 
 
520 aa  246  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  29.65 
 
 
563 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.83 
 
 
568 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  35.56 
 
 
520 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  31.56 
 
 
577 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  35.95 
 
 
596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  34.63 
 
 
580 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  30.52 
 
 
501 aa  246  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  33.41 
 
 
503 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  36.55 
 
 
569 aa  244  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  35.75 
 
 
487 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  29.08 
 
 
555 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  30.7 
 
 
573 aa  244  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  34.83 
 
 
578 aa  244  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.26 
 
 
568 aa  244  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  34.57 
 
 
520 aa  243  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  34.91 
 
 
523 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  31.42 
 
 
520 aa  243  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  28.32 
 
 
563 aa  243  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  29.64 
 
 
568 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  28.43 
 
 
564 aa  242  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  29.19 
 
 
568 aa  242  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.64 
 
 
568 aa  242  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  29.33 
 
 
586 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  32.7 
 
 
493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  32.7 
 
 
493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  34.41 
 
 
521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  31.18 
 
 
727 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  32.7 
 
 
493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  35.14 
 
 
575 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  34.16 
 
 
521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.42 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  34.15 
 
 
567 aa  241  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  29.33 
 
 
586 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  29.33 
 
 
586 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>