More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1299 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1299  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 
747 aa  1529    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1268  General secretory system II protein E domain protein  98.39 
 
 
747 aa  1506    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2264  type II secretion system protein E  36.86 
 
 
769 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  37.6 
 
 
673 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  37.6 
 
 
673 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
676 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  39.04 
 
 
670 aa  416  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  37.07 
 
 
670 aa  415  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  37.25 
 
 
666 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
668 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
723 aa  353  7e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  32.45 
 
 
638 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  30.71 
 
 
553 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  28.09 
 
 
555 aa  193  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  27.47 
 
 
891 aa  192  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  28.99 
 
 
558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  29.18 
 
 
553 aa  190  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  26.98 
 
 
557 aa  188  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  29.93 
 
 
594 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.31 
 
 
568 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.47 
 
 
568 aa  187  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.47 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  28.46 
 
 
571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  27.8 
 
 
568 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  28.42 
 
 
871 aa  185  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  28.05 
 
 
577 aa  184  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  28.72 
 
 
489 aa  182  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  27.13 
 
 
553 aa  182  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  26.96 
 
 
557 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  27.75 
 
 
566 aa  181  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  26.64 
 
 
514 aa  180  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  27.23 
 
 
482 aa  180  7e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  24.91 
 
 
560 aa  179  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  30.25 
 
 
513 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  26.96 
 
 
521 aa  178  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  26.04 
 
 
569 aa  178  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.38 
 
 
563 aa  178  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  28.69 
 
 
515 aa  177  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.88 
 
 
571 aa  177  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.71 
 
 
568 aa  177  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  25.94 
 
 
556 aa  176  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  31.25 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  31.25 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  26.85 
 
 
577 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  26.34 
 
 
565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  26.24 
 
 
573 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  31.25 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  27.44 
 
 
561 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  26.97 
 
 
599 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.78 
 
 
568 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  26.21 
 
 
520 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  27.03 
 
 
568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  27.87 
 
 
499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  25.38 
 
 
552 aa  174  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  27.88 
 
 
499 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  31.25 
 
 
493 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  25.08 
 
 
603 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  31.25 
 
 
493 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  27.96 
 
 
499 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  26.9 
 
 
568 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  27.66 
 
 
499 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  27.13 
 
 
498 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  27.66 
 
 
499 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06911  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like protein  29.81 
 
 
568 aa  174  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  29.42 
 
 
561 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  28.54 
 
 
577 aa  174  7.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  25.05 
 
 
573 aa  173  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  29.12 
 
 
521 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  25.63 
 
 
787 aa  172  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  27.37 
 
 
599 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  27.78 
 
 
563 aa  172  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  25.97 
 
 
562 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  28.85 
 
 
521 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  29.12 
 
 
514 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  26.3 
 
 
521 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  26.97 
 
 
599 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  24.68 
 
 
568 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.96 
 
 
568 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  28.85 
 
 
521 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  27.67 
 
 
499 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  28.85 
 
 
521 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  28.85 
 
 
521 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  28.85 
 
 
521 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  26.22 
 
 
888 aa  171  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  28.85 
 
 
523 aa  171  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.18 
 
 
568 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  26.33 
 
 
507 aa  170  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  27.41 
 
 
570 aa  170  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  29.87 
 
 
468 aa  170  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  25.31 
 
 
563 aa  170  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
563 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  30.45 
 
 
497 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  30.45 
 
 
497 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  30.45 
 
 
497 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  30.45 
 
 
497 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  30.45 
 
 
497 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  30.45 
 
 
497 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  27.29 
 
 
522 aa  170  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  29.4 
 
 
523 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  26.52 
 
 
521 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>