More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1268 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1268  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 
747 aa  1530    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1299  General secretory system II protein E domain protein  98.39 
 
 
747 aa  1506    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2264  type II secretion system protein E  36.42 
 
 
769 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  37.05 
 
 
673 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  37.05 
 
 
673 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  35.84 
 
 
676 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  38.39 
 
 
670 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  36.74 
 
 
670 aa  412  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  36.86 
 
 
666 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  36.08 
 
 
668 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  31.83 
 
 
723 aa  349  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  31.64 
 
 
638 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  30.5 
 
 
553 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  27.51 
 
 
891 aa  198  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  28.26 
 
 
555 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  29.58 
 
 
558 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  29.32 
 
 
553 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  26.09 
 
 
557 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  27.18 
 
 
577 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  28.27 
 
 
871 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  27.87 
 
 
577 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  26.83 
 
 
553 aa  183  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.97 
 
 
568 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.97 
 
 
568 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  26.38 
 
 
569 aa  182  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.4 
 
 
568 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  27.78 
 
 
571 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  27.97 
 
 
568 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  29.93 
 
 
594 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  26.79 
 
 
557 aa  180  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  28.36 
 
 
489 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  28.19 
 
 
482 aa  179  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  26.58 
 
 
514 aa  178  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  27.13 
 
 
888 aa  177  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.91 
 
 
568 aa  177  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.69 
 
 
571 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  25.47 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  28.88 
 
 
577 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  26.74 
 
 
521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  25.74 
 
 
556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  27.23 
 
 
566 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  24.34 
 
 
560 aa  175  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  27.54 
 
 
599 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  26 
 
 
520 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.49 
 
 
563 aa  174  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  30.02 
 
 
513 aa  174  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  27.44 
 
 
561 aa  173  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  26.15 
 
 
565 aa  173  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.57 
 
 
568 aa  173  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  25.66 
 
 
885 aa  173  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  25.64 
 
 
603 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  29.28 
 
 
561 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  27.54 
 
 
599 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  26.01 
 
 
585 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  24.62 
 
 
568 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  27.93 
 
 
599 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  28.27 
 
 
515 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  28.85 
 
 
521 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  26.48 
 
 
573 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  28.85 
 
 
514 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.92 
 
 
568 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  25.13 
 
 
787 aa  171  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  27.82 
 
 
570 aa  171  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  28.85 
 
 
523 aa  171  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  28.57 
 
 
521 aa  171  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  25.66 
 
 
562 aa  170  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  26.56 
 
 
507 aa  170  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  24.67 
 
 
573 aa  170  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  26.09 
 
 
521 aa  170  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  26.49 
 
 
568 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  28.57 
 
 
521 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  28.57 
 
 
521 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  28.57 
 
 
521 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  27.63 
 
 
561 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  30.73 
 
 
563 aa  170  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  26.69 
 
 
568 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  27 
 
 
515 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  28.3 
 
 
417 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  28.57 
 
 
521 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  26.95 
 
 
564 aa  169  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  27.34 
 
 
563 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  30.73 
 
 
493 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  30.73 
 
 
493 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06911  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like protein  29.4 
 
 
568 aa  169  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  30.73 
 
 
493 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  26.54 
 
 
497 aa  168  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  26.73 
 
 
497 aa  168  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  26.73 
 
 
497 aa  168  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  29.12 
 
 
523 aa  168  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  26.54 
 
 
497 aa  168  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  28.3 
 
 
521 aa  167  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  30.73 
 
 
493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  28.94 
 
 
591 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  30.73 
 
 
493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  26.35 
 
 
576 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  27.41 
 
 
499 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  27.25 
 
 
499 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3859  type II secretion system protein E  25.2 
 
 
568 aa  167  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  28.69 
 
 
557 aa  167  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  29.19 
 
 
561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>