188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_30031 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  100 
 
 		 372 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  52.41 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  52 
 
 		 350 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  43.1 
 
 		 370 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  51.31 
 
 		 302 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.01 
 
 		 360 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  28.7 
 
 		 360 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.7 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.28 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  34.18 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 379 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.38 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.49 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  29.06 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.35 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.53 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  29.55 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.01 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  28.25 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.81 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.57 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  22.13 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.13 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  27.39 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  27.19 
 
 		 652 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.97 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  25.48 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  26.39 
 
 		 385 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  27.46 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3505  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  28.3 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  26.12 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  25.74 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  30.66 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.71 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  31.14 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  25.48 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  24.79 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  27.65 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  32.3 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  25.85 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  22.37 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  31.71 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.73 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  25.31 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.34 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  24.93 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  27.22 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  26.36 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  33.79 
 
 		 666 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.04 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  24.27 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.84 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.47 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.87 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1542  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.34 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.224585  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.47 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  22.42 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  22.79 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  33.1 
 
 		 666 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  22.31 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.11 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.89 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  22.04 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.89 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  25.54 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  26.28 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  24.21 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>