More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38551 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_38551  predicted protein  100 
 
 
794 aa  1588    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  39.42 
 
 
722 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.95 
 
 
706 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.65 
 
 
712 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.73 
 
 
716 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.73 
 
 
716 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.59 
 
 
726 aa  473  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  37.22 
 
 
716 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.76 
 
 
724 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  38.51 
 
 
718 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  38.71 
 
 
718 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.33 
 
 
722 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.32 
 
 
722 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.16 
 
 
713 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  38.64 
 
 
724 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.14 
 
 
722 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.48 
 
 
722 aa  451  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  38.95 
 
 
718 aa  452  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  40.9 
 
 
721 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  39.61 
 
 
721 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  38.38 
 
 
722 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  36.1 
 
 
720 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  35.97 
 
 
720 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  38.24 
 
 
722 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  40.03 
 
 
728 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.62 
 
 
713 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  37.97 
 
 
722 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.62 
 
 
713 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  35.58 
 
 
730 aa  443  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  38.56 
 
 
777 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  35.99 
 
 
762 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  37.7 
 
 
724 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  37.7 
 
 
724 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  37.7 
 
 
724 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  38.43 
 
 
788 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  38.76 
 
 
787 aa  442  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  37.7 
 
 
722 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  37.85 
 
 
779 aa  439  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  37.57 
 
 
722 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2413  RNA binding S1 domain protein  37.53 
 
 
736 aa  439  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.746859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  38.11 
 
 
802 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  36.17 
 
 
699 aa  431  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  37.07 
 
 
721 aa  428  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.76 
 
 
798 aa  428  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  38.82 
 
 
703 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  37.29 
 
 
765 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  38.85 
 
 
795 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  38.52 
 
 
781 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.71 
 
 
782 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.65 
 
 
778 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  38.26 
 
 
782 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  38.3 
 
 
795 aa  418  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  38.55 
 
 
717 aa  419  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  35.64 
 
 
707 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  37.3 
 
 
705 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  37.22 
 
 
720 aa  414  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.3 
 
 
780 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1862  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.19 
 
 
827 aa  415  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  37.34 
 
 
713 aa  416  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  36.67 
 
 
710 aa  413  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1810  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.94 
 
 
728 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547595  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.77 
 
 
788 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  35.77 
 
 
727 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  39.08 
 
 
761 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.05 
 
 
720 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0539  RNA binding S1 domain protein  39.32 
 
 
769 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500263  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3444  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.17 
 
 
787 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1460  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.55 
 
 
773 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0675238  normal  0.590936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2332  RNA binding S1 domain protein  37.76 
 
 
838 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.430037  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1997  Resolvase RNase H domain protein  37.52 
 
 
798 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0478304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.55 
 
 
707 aa  409  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2875  RNA binding S1 domain protein  37.71 
 
 
791 aa  409  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0291  RNA binding S1 domain protein  38.61 
 
 
710 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0584  RNA binding S1 domain protein  39.08 
 
 
769 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.717148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.84 
 
 
774 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1707  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.26 
 
 
798 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.700604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1792  putative transcription accessory protein  37.58 
 
 
793 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781108  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  37.99 
 
 
774 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.22 
 
 
786 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  35.62 
 
 
718 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  37.99 
 
 
774 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  37.34 
 
 
772 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  37.99 
 
 
821 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1628  Tex-like protein protein-like protein  38.11 
 
 
796 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0587  RNA binding S1 domain protein  36.96 
 
 
777 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  38.17 
 
 
757 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  37.65 
 
 
782 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  38.21 
 
 
775 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  37.99 
 
 
774 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.91 
 
 
723 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  37.99 
 
 
774 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  37.99 
 
 
774 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  37.99 
 
 
774 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  35.33 
 
 
760 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  38.02 
 
 
777 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  36.89 
 
 
799 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  37.18 
 
 
803 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  36.63 
 
 
798 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0767  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.79 
 
 
720 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3200  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.59 
 
 
785 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0648133  normal  0.853857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>