More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1997 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  57.77 
 
 		 772 aa  841    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  57.77 
 
 		 773 aa  840    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.88 
 
 		 787 aa  825    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  57.52 
 
 		 861 aa  829    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.94 
 
 		 784 aa  865    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  55.04 
 
 		 773 aa  813    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  58.85 
 
 		 735 aa  830    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  61.86 
 
 		 779 aa  920    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2122  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.09 
 
 		 849 aa  643    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161735  normal  0.0955174 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  60.5 
 
 		 774 aa  869    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  52.25 
 
 		 796 aa  791    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1706  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.62 
 
 		 803 aa  803    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.96157 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  56.45 
 
 		 767 aa  805    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4629  hypothetical protein  55.12 
 
 		 784 aa  822    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  57.73 
 
 		 773 aa  844    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.76 
 
 		 803 aa  809    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  60.5 
 
 		 774 aa  869    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7512  transcriptional accessory protein  58.48 
 
 		 771 aa  835    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3413  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.81 
 
 		 777 aa  788    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.65 
 
 		 774 aa  832    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  60.5 
 
 		 774 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  60.5 
 
 		 774 aa  869    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2891  hypothetical protein  53.35 
 
 		 789 aa  798    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  53.35 
 
 		 789 aa  798    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0686  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.7 
 
 		 768 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  57.79 
 
 		 772 aa  839    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  57.77 
 
 		 773 aa  840    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  57.48 
 
 		 772 aa  858    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  59.01 
 
 		 777 aa  851    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  63.26 
 
 		 802 aa  920    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1945  hypothetical protein  58.75 
 
 		 800 aa  816    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10863  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2166  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.3 
 
 		 780 aa  783    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.897398  normal  0.40683 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  60.38 
 
 		 821 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  53.91 
 
 		 765 aa  808    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  57.89 
 
 		 774 aa  861    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0774  RNA binding protein  54.76 
 
 		 773 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  50.13 
 
 		 759 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  60.44 
 
 		 774 aa  859    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  54.65 
 
 		 766 aa  802    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.44 
 
 		 774 aa  867    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.25 
 
 		 787 aa  825    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3444  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.23 
 
 		 787 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  58.63 
 
 		 790 aa  837    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  60.68 
 
 		 775 aa  854    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0217  RNA binding S1  58.98 
 
 		 864 aa  808    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  60.5 
 
 		 774 aa  869    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3277  RNA binding S1  55.93 
 
 		 799 aa  827    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1703  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.57 
 
 		 797 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247477  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2483  RNA binding S1  75.71 
 
 		 807 aa  1178    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  58.73 
 
 		 772 aa  855    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  56.75 
 
 		 782 aa  842    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  77.63 
 
 		 803 aa  1248    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  60.17 
 
 		 781 aa  904    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  56.02 
 
 		 799 aa  806    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2189  RNA binding S1  55.91 
 
 		 798 aa  824    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2655  RNA binding S1  57.66 
 
 		 804 aa  814    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.047572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  58.67 
 
 		 778 aa  833    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  57.9 
 
 		 773 aa  842    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  60.62 
 
 		 787 aa  917    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0703  RNA binding S1  55.08 
 
 		 814 aa  775    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509283  normal  0.104907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2430  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.76 
 
 		 773 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  60.82 
 
 		 815 aa  863    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1792  putative transcription accessory protein  74.74 
 
 		 793 aa  1156    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781108  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3402  RNA binding S1  56.81 
 
 		 777 aa  788    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  56.81 
 
 		 775 aa  865    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  58.06 
 
 		 772 aa  799    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6672  RNA-binding S1 domain-containing protein  58.72 
 
 		 901 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3982  hypothetical protein  56.17 
 
 		 791 aa  847    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1466  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.73 
 
 		 769 aa  763    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  57.07 
 
 		 767 aa  815    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3809  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.33 
 
 		 779 aa  825    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3885  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.49 
 
 		 779 aa  826    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  59.14 
 
 		 782 aa  873    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0235  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.06 
 
 		 790 aa  826    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  60.46 
 
 		 774 aa  859    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  59.54 
 
 		 779 aa  855    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3820  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.67 
 
 		 776 aa  836    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.98 
 
 		 777 aa  832    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3804  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.77 
 
 		 813 aa  813    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.85 
 
 		 787 aa  838    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0405  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.35 
 
 		 772 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0895  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.39 
 
 		 861 aa  771    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  60.82 
 
 		 774 aa  864    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  59.66 
 
 		 779 aa  861    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1460  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.94 
 
 		 773 aa  791    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0675238  normal  0.590936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4013  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.64 
 
 		 779 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.89 
 
 		 804 aa  833    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4458  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.82 
 
 		 770 aa  776    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.135865  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.77 
 
 		 798 aa  839    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  57.04 
 
 		 778 aa  848    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1042  RNA-binding S1 domain-containing protein  81.02 
 
 		 794 aa  1270    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.889463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3465  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.81 
 
 		 777 aa  788    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1810  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.66 
 
 		 728 aa  695    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547595  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3200  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.93 
 
 		 785 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0648133  normal  0.853857 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  60.5 
 
 		 774 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  57.7 
 
 		 774 aa  879    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.13 
 
 		 787 aa  825    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  86.3 
 
 		 788 aa  1365    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  77.07 
 
 		 778 aa  1226    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1707  RNA-binding S1 domain-containing protein  98.75 
 
 		 798 aa  1591    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.700604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>