188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2669 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 372 aa  741    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  40.34 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  41.87 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.93 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.39 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  41.87 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  41.87 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.89 
 
 		 414 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  37.76 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.74 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.08 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.75 
 
 		 361 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  31.97 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.31 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  30.06 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  29.37 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.46 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  26.35 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.24 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  30 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  28.29 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  27.49 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  27.56 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  23.71 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  28.38 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  26.99 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  28.19 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  28.29 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.71 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.76 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  28.29 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  28.29 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.25 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  26.91 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  27.13 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  26.4 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  23.33 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  31.43 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  29.71 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  29.71 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  26.32 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  26.72 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  26.72 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3045  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.76 
 
 		 637 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  24.6 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  26.27 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  24.38 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  23.93 
 
 		 505 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  24.38 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.88 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  21.37 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.88 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  24.8 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  30.06 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2336  phage shock protein operon transcriptional activator  33.8 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.816239  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1721  phage shock protein operon transcriptional activator  34.85 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0328875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1915  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  33.64 
 
 		 467 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0712701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2611  phage shock protein operon transcriptional activator  33.8 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  25.37 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3592  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.88 
 
 		 519 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1284  psp operon transcriptional activator  35.66 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1893  phage shock protein operon transcriptional activator  32.39 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0234  Sigma 54 interacting domain protein  30.08 
 
 		 576 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2538  phage shock protein operon transcriptional activator  32.39 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1785  phage shock protein operon transcriptional activator  32.39 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3227  Fis family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0480  psp operon transcriptional activator PspF  34.29 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2625  phage shock protein operon transcriptional activator  32.39 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1002  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1753  phage shock protein operon transcriptional activator  33.85 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0082  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.54 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  28.68 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1226  sigma54 specific transcriptional activator, PspF, Fis family  32.58 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1061  transcriptional regulator NifA  32.59 
 
 		 582 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.798583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  23.93 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  22.97 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01280  DNA-binding transcriptional activator  34.11 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2343  sigma54 specific transcriptional acivator, PspF, Fis family  34.11 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00890881  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 458 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1401  NifA subfamily transcriptional regulator  33.33 
 
 		 562 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01291  hypothetical protein  34.11 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1819  phage shock protein operon transcriptional activator  34.11 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2322  phage shock protein operon transcriptional activator  34.11 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.333192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1945  phage shock protein operon transcriptional activator  34.11 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1418  phage shock protein operon transcriptional activator  34.11 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1513  phage shock protein operon transcriptional activator  34.11 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3774  sigma-54 depedent transcriptional activator PspF  30.77 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4475  transcriptional regulator NifA  31.71 
 
 		 580 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6499  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 458 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6734  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 458 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2552  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.33 
 
 		 525 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2456  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.33 
 
 		 525 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0352047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2170  phage shock protein operon transcriptional activator  35.43 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0948049  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0405  Fis family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 338 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2579  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family protein  31.43 
 
 		 359 aa  46.2  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0381  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.4 
 
 		 663 aa  46.2  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.24565  normal  0.15807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1816  phage shock protein operon transcriptional activator  34.11 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.233716 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  26.87 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0383  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.07 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>