90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1808 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 398 aa  782    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  46.53 
 
 		 414 aa  262  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.68 
 
 		 414 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.44 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.79 
 
 		 360 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.84 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  40.44 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  39.77 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  39.77 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.27 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.74 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  30.84 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.69 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  27.02 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  32.53 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.63 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  33.55 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  36.82 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.97 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  31.49 
 
 		 347 aa  98.2  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  31.94 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  29.82 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  30.5 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  29.55 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  24.45 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.3 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  24.53 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  28.23 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  28.23 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  30.49 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  25.91 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.65 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  28.12 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.45 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  26.09 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  27.02 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  26.33 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  26.64 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  24.11 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  26.59 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  26.17 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  25.57 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  24.18 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  23.93 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  23.93 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  25.66 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  24.76 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  26.35 
 
 		 341 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.5 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  28.28 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  25.39 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  25.81 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  25.81 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  31.65 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  26.72 
 
 		 505 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  25.94 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  26.19 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000789925  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  28.14 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  30.99 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  31.68 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  31.68 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  31.68 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  25.34 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  30.69 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.75 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  31.68 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  27.57 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  31.51 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  30.98 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  29.38 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  30.69 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  29.7 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  25 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  24.84 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  30.69 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3801  ATPase  28.57 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  29.7 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.64 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  33.33 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  29.7 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.51 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  26.43 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  30.69 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  27.66 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  27.11 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.06 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  23.6 
 
 		 309 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  30.51 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  29.85 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>