104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3480 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 367 aa  701    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  58.4 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  57.58 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  57.58 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45 
 
 		 360 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.54 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  41.86 
 
 		 414 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.48 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.82 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.81 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.43 
 
 		 398 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  34.77 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.82 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  34.87 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.5 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  29.34 
 
 		 365 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  29.41 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  30.03 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  31.59 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  32.56 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  29.59 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  32.55 
 
 		 379 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  30.82 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  33.33 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.49 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  26.4 
 
 		 360 aa  96.3  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  30.24 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  29.84 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  29.84 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.85 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  27.76 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  27.76 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.83 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  32.8 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.69 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  28.16 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  23.34 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  32.77 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  24.04 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.74 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  24.03 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  31.4 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  32.02 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  27.95 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  31.76 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  24.14 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  28.8 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  28.74 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  30.59 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  24.82 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  35.04 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  29.2 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  29.2 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  26.42 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  20.83 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  24.81 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  26.38 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  21.59 
 
 		 489 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  25.27 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  28.09 
 
 		 335 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  27.62 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3262  Fis family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 581 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0731246  hitchhiker  0.00134549 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  33.33 
 
 		 515 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1100  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.2 
 
 		 586 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1494  Fis family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 574 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3204  Fis family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 570 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.832965  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1061  transcriptional regulator NifA  29.5 
 
 		 582 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.798583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0335  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 445 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3045  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  29.5 
 
 		 637 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  27.12 
 
 		 303 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4475  transcriptional regulator NifA  31.5 
 
 		 580 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5933  NifA subfamily transcriptional regulator  29.41 
 
 		 580 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  26.32 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  23.42 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  25 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2288  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.22 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625134  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.26 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  29.29 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1284  psp operon transcriptional activator  43.08 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0256  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  27.39 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.12 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3227  Fis family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2958  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  32.05 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0547  NifA subfamily transcriptional regulator  30.82 
 
 		 581 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5349  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.982253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2198  transcriptional regulator NifA  30.82 
 
 		 581 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1721  flagellar regulatory protein A  26.14 
 
 		 488 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000009386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0215  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.06 
 
 		 528 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0571306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.86 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2338  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 479 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501829 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  21.58 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.34 
 
 		 308 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  22.27 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  28.69 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  22.27 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  30.33 
 
 		 303 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1185  NifA subfamily transcriptional regulator  26.32 
 
 		 670 aa  43.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.132433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3418  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.8 
 
 		 573 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.47 
 
 		 521 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>