More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2416 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2416  ATPase  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  77.85 
 
 
303 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  76.57 
 
 
303 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  76.57 
 
 
303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  73.6 
 
 
303 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  73.27 
 
 
303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  72.28 
 
 
303 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.44 
 
 
303 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  74.39 
 
 
303 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  74.39 
 
 
303 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  74.74 
 
 
303 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  74.74 
 
 
313 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  75.09 
 
 
303 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  75.09 
 
 
303 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  70.2 
 
 
303 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  67.01 
 
 
309 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  68.42 
 
 
315 aa  411  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  63.21 
 
 
312 aa  350  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  57.38 
 
 
305 aa  349  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  57.04 
 
 
303 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  54.49 
 
 
315 aa  337  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  57.5 
 
 
306 aa  334  9e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.6 
 
 
331 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  57 
 
 
305 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  56.54 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  54.58 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  52.81 
 
 
350 aa  325  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  56.66 
 
 
305 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  57.52 
 
 
305 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  53.58 
 
 
315 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  57.52 
 
 
305 aa  322  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  53.82 
 
 
306 aa  321  9.000000000000001e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  57.93 
 
 
305 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.64 
 
 
317 aa  318  6e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  55.33 
 
 
308 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  55.91 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  52.22 
 
 
308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.55 
 
 
300 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  59.85 
 
 
321 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  53.05 
 
 
306 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.32 
 
 
335 aa  310  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.15 
 
 
306 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.11 
 
 
323 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.11 
 
 
323 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  53.19 
 
 
335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  52.71 
 
 
306 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  54.51 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  50.85 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  56.88 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  54.32 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.11 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  54.35 
 
 
304 aa  302  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.51 
 
 
317 aa  301  6.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  53.96 
 
 
306 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  53.99 
 
 
304 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  51.68 
 
 
317 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  53.9 
 
 
310 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  50.54 
 
 
306 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  56.19 
 
 
315 aa  295  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.48 
 
 
306 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
329 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  52.48 
 
 
306 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.65 
 
 
308 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  50.18 
 
 
310 aa  290  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.05 
 
 
313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.51 
 
 
310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  48.58 
 
 
323 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  51.32 
 
 
317 aa  282  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  50 
 
 
347 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  47.42 
 
 
320 aa  280  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  45.54 
 
 
320 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.06 
 
 
320 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.72 
 
 
318 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  45.54 
 
 
320 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.44 
 
 
327 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.4 
 
 
320 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 
330 aa  278  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.55 
 
 
320 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.06 
 
 
320 aa  278  9e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.12 
 
 
306 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.12 
 
 
306 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  51.07 
 
 
349 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.67 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.45 
 
 
327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.97 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.89 
 
 
327 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  44.15 
 
 
314 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.93 
 
 
310 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.12 
 
 
306 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.62 
 
 
325 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  48.36 
 
 
350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.18 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  42.95 
 
 
302 aa  269  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  43.96 
 
 
302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.46 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  45.7 
 
 
296 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  45.85 
 
 
309 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  45.7 
 
 
296 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  46.4 
 
 
331 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.39 
 
 
302 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>