More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8670 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 414 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  61.33 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.49 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.68 
 
 		 398 aa  262  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.93 
 
 		 361 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.48 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.59 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  42.32 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  41.32 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  41.32 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  34.99 
 
 		 379 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  37.46 
 
 		 365 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.35 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  37.58 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  38.06 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  34.28 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  31.33 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.44 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  34.08 
 
 		 347 aa  126  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  34.1 
 
 		 332 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  34.03 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  30.89 
 
 		 332 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.58 
 
 		 347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.94 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  31.72 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  30.56 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.03 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  31.54 
 
 		 341 aa  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  33.92 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  33.92 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  26.74 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  29.07 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  28.66 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  30.24 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  29.59 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  28.28 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  22.62 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  31.14 
 
 		 372 aa  79.7  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  22.62 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  27.6 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.57 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  29.03 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  28.86 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  28.86 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  26.83 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  25.64 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  27.8 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  27.8 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  23.72 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  24.88 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  27.95 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  27.89 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  34.01 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  24.15 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  25.78 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  29.85 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  20.8 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2749  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.97 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778475  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  24.59 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  28.23 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  27.3 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1763  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.09 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0693  sigma-54 dependent transcriptional regulator  28.27 
 
 		 643 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0842  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.27 
 
 		 697 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.801762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  35.2 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  26.7 
 
 		 306 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3045  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.4 
 
 		 637 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3204  Fis family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 570 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.832965  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.68 
 
 		 521 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.19 
 
 		 459 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  30.87 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0545  arginine utilization regulatory protein RocR  30.3 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000949535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1892  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  30.56 
 
 		 582 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  27.44 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0383  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0545  arginine utilization regulatory protein RocR  30.3 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.660554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0403  arginine utilization regulatory protein  30.3 
 
 		 467 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.4 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  33.55 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1542  Fis family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.115616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  35.17 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3104  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08880  sigma54-dependent activator protein, XylR/DmpR family  28.8 
 
 		 564 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  33.55 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3175  putative GAF sensor protein  30.71 
 
 		 629 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.54 
 
 		 271 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3573  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  29.13 
 
 		 591 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.75 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.62 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1486  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.51 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0842644  hitchhiker  0.0000000147012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2805  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.43 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.228775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3636  sigma54 specific transcriptional regulator  29.53 
 
 		 616 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  28.9 
 
 		 611 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0505  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.33 
 
 		 587 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2498  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.45 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1848  putative sigma54 specific transcriptional regulator  26.28 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2828  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.48 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3227  Fis family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 362 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3661  sigma-54 factor, interaction region  33.58 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>