140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5625 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  100 
 
 
368 aa  714    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  100 
 
 
368 aa  714    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  89.13 
 
 
368 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.01 
 
 
367 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.87 
 
 
372 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.62 
 
 
360 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  39.42 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  37.5 
 
 
379 aa  192  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.83 
 
 
398 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.66 
 
 
361 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.32 
 
 
418 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.32 
 
 
414 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  32.09 
 
 
379 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.43 
 
 
330 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.72 
 
 
327 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  31.84 
 
 
347 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  29.32 
 
 
365 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  31.54 
 
 
327 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  31.68 
 
 
348 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  31.54 
 
 
348 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  28.21 
 
 
332 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.23 
 
 
364 aa  93.2  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  29.82 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.85 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.29 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  27.41 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  26.24 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  30.8 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  27.44 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  31.72 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  29.49 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  25.1 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  29.39 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.56 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  28.93 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  28.86 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  28.86 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  27.86 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  26.62 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  27.48 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  32.17 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  25.94 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  29.3 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  22.14 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.8 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  29.3 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  25.94 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  24.29 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  29.5 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  26.77 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  26.56 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  34.78 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  25.87 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.33 
 
 
521 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  27.81 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  25.83 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  20.69 
 
 
489 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1494  Fis family transcriptional regulator  33.09 
 
 
574 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.97 
 
 
331 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.65 
 
 
313 aa  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  31.58 
 
 
362 aa  49.7  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  28.38 
 
 
302 aa  49.7  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  21.43 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  29.27 
 
 
4844 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  27.7 
 
 
4979 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  28.47 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  28.47 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3262  Fis family transcriptional regulator  30.56 
 
 
581 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0731246  hitchhiker  0.00134549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  28.47 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  28.47 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.47 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  32.41 
 
 
4917 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2958  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.84 
 
 
472 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  29.17 
 
 
303 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  27.48 
 
 
383 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  29.86 
 
 
303 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  31.65 
 
 
306 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  28.47 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  28.47 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  28.47 
 
 
313 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.63 
 
 
308 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.82 
 
 
317 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  27.91 
 
 
264 aa  46.6  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.29 
 
 
345 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  27.56 
 
 
387 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  20.7 
 
 
505 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.63 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  27.47 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  31.25 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  27.47 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  27.47 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0750  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.11 
 
 
576 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  31.88 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.65 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  32.26 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  32.61 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  31.72 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  29.61 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  32.26 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.41 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>