75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1729 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 330 aa  662    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.97 
 
 		 327 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  58.79 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  43.41 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  45.95 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  44.41 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  42.81 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  39.14 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  42.64 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.56 
 
 		 347 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.6 
 
 		 347 aa  208  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  41.96 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  37.84 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  44.53 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  42.26 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  37.76 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  33.87 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  41.26 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  39.43 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  41.89 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  36.97 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.26 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  43.53 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  39.61 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  40 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  39.06 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  39.06 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  38.35 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  33.23 
 
 		 354 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  33.23 
 
 		 354 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  42.58 
 
 		 369 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  34.31 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.88 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.03 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  31.43 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  31.43 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.98 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.52 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  27.03 
 
 		 359 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  29.86 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.09 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  31.8 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  34.29 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.97 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  33.88 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.46 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  34.48 
 
 		 367 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  35.38 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  27.73 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  26.24 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  24.62 
 
 		 489 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  26.62 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.58 
 
 		 521 aa  86.3  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  29.46 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  30.36 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  24.06 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  30.67 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  23.94 
 
 		 505 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  26.06 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  27.3 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  30.12 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  23.61 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  26.67 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  28.52 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  26.99 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  29.45 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  25.33 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  25.44 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.92 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.12 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.21 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.63 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.41 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 		 356 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>