More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2094 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
356 aa  730    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.88 
 
 
327 aa  531  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  58.97 
 
 
356 aa  408  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.39 
 
 
327 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.03 
 
 
341 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.71 
 
 
341 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  57.45 
 
 
338 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  58.06 
 
 
343 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  54.52 
 
 
317 aa  360  2e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.94 
 
 
351 aa  359  5e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.89 
 
 
379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.16 
 
 
345 aa  357  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.21 
 
 
349 aa  352  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  53.58 
 
 
317 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.02 
 
 
338 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.7 
 
 
320 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.88 
 
 
334 aa  342  7e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.79 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  51.96 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 
308 aa  336  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.44 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  51.11 
 
 
324 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  51.58 
 
 
324 aa  322  7e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  49.2 
 
 
336 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  51.66 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  50.16 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  50.16 
 
 
349 aa  311  7.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  49.84 
 
 
343 aa  311  9e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.7 
 
 
333 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  51.62 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  48.56 
 
 
335 aa  308  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  49.2 
 
 
342 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  51.15 
 
 
318 aa  308  8e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  48.24 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  47.22 
 
 
325 aa  305  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.39 
 
 
329 aa  305  7e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  47.4 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  47.92 
 
 
335 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  46.65 
 
 
328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.87 
 
 
336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  50.49 
 
 
339 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  47.73 
 
 
329 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  46.83 
 
 
340 aa  300  2e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.21 
 
 
336 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  47.08 
 
 
334 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.88 
 
 
313 aa  300  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  47.35 
 
 
340 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.85 
 
 
325 aa  298  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.4 
 
 
341 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  47.27 
 
 
337 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.32 
 
 
333 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  51.29 
 
 
318 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.4 
 
 
333 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  47.04 
 
 
335 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.52 
 
 
329 aa  293  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  46.39 
 
 
338 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  50.83 
 
 
318 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  46.43 
 
 
331 aa  288  7e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  49.01 
 
 
336 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  48.7 
 
 
327 aa  288  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  44.92 
 
 
328 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.33 
 
 
336 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.34 
 
 
336 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  48.33 
 
 
336 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.41 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.67 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.05 
 
 
331 aa  286  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  44.19 
 
 
330 aa  286  4e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  47.54 
 
 
332 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  45.45 
 
 
338 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  45.45 
 
 
338 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.91 
 
 
353 aa  285  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
327 aa  285  8e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.07 
 
 
342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  50.65 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  50.5 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  46.41 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  45.81 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.89 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  45.85 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.75 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  48.01 
 
 
334 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  47.52 
 
 
333 aa  281  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  47.38 
 
 
333 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  46.15 
 
 
333 aa  280  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  47 
 
 
362 aa  279  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 
350 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  48.55 
 
 
320 aa  279  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.56 
 
 
334 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  42.94 
 
 
332 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.25 
 
 
332 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  47.91 
 
 
324 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  47.54 
 
 
332 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.6 
 
 
333 aa  277  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.51 
 
 
334 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  45.7 
 
 
335 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  47.71 
 
 
332 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  46.6 
 
 
318 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>