108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1600 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  100 
 
 		 332 aa  670    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  83.43 
 
 		 332 aa  541  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.93 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  47.08 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 		 330 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  39.57 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  35.84 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  36.62 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.3 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  36.86 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.12 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  37.42 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  33.64 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  33.64 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  41.02 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  35.58 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  31.09 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  35.11 
 
 		 369 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  34.1 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  34.04 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.87 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  33.69 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  33.68 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  35.38 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.05 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  33.71 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  29.49 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.91 
 
 		 360 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  31.6 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  31.6 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  30.86 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  28.16 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.95 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.09 
 
 		 414 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  30.79 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  32.03 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  30.68 
 
 		 351 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  30.68 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  29.22 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.52 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  34.1 
 
 		 369 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  29.04 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  29.04 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.85 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.58 
 
 		 361 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.56 
 
 		 398 aa  95.9  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  29.04 
 
 		 368 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  24.8 
 
 		 359 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  30.54 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  31.54 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  24.27 
 
 		 505 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  28.04 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.79 
 
 		 521 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  27.67 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  26.88 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  24.4 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  28.08 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  27.91 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  27.57 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  27.27 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  22.93 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  24.06 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  26.34 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  26.34 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  24.55 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  24.23 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  25.33 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  30.63 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.55 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  27.85 
 
 		 508 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  27.85 
 
 		 508 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  32.56 
 
 		 434 aa  46.6  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  29.91 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  32.53 
 
 		 420 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  38.89 
 
 		 461 aa  46.2  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  32.5 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.05 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  32.26 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  31.43 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.48 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1359  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 472 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  31.17 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.08 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  28.3 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0405  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2503  putative regulatory protein  30 
 
 		 475 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  28 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  29.07 
 
 		 425 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.62 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.5 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2549  putative regulatory protein  30 
 
 		 475 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2603  putative regulatory protein  30 
 
 		 475 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2591  putative regulatory protein  30 
 
 		 475 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.43464 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2712  putative regulatory protein  30 
 
 		 475 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  31.43 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  29.25 
 
 		 267 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  28.57 
 
 		 434 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  25.6 
 
 		 423 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>