76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0637 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  98.38 
 
 
371 aa  745    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  754    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  46.25 
 
 
396 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  27.09 
 
 
383 aa  142  8e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  29.89 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  29.32 
 
 
351 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  28.57 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  29.07 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  27.72 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  25.95 
 
 
360 aa  106  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  25.09 
 
 
302 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  27.86 
 
 
331 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  24.52 
 
 
340 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  25.29 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.24 
 
 
330 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  27.95 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  26.29 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  26.46 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  25.59 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.34 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  24.9 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  23.48 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.68 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 
347 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.09 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  26.17 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  22.5 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  25 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.29 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.88 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  24.29 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  23.36 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  22.14 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  22.14 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  24.6 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  24.6 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  25.98 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  28.84 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  19.79 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  27.91 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  21.93 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  24.81 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  24.81 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  25.55 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.3 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  20.61 
 
 
353 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.79 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  20.95 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  22.01 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.28 
 
 
361 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.71 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  21.64 
 
 
353 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.49 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  20.71 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  21.26 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  21.1 
 
 
521 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  21.74 
 
 
369 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  22.22 
 
 
489 aa  53.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  25 
 
 
369 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  24.28 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 
365 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  20.75 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  22.09 
 
 
505 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2735  helix-turn-helix, Fis-type  27.81 
 
 
587 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2951  sigma-54 dependent transcriptional regulator  26.85 
 
 
561 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  20.87 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  22.86 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1677  ATPase AAA-2  28.3 
 
 
845 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.220039  normal  0.716629 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1498  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  28.3 
 
 
849 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296349  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  26.83 
 
 
830 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1591  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  28.3 
 
 
854 aa  43.9  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0126438  hitchhiker  0.0000548277 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  29.91 
 
 
474 aa  43.5  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  25.26 
 
 
304 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.74 
 
 
251 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  28.57 
 
 
475 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1825  ATPase  24.26 
 
 
339 aa  42.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.953694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>