110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3478 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 365 aa  723    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.54 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.16 
 
 		 414 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.69 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  33.94 
 
 		 414 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.04 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.27 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.49 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  29.62 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.63 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  29.88 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  29.88 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  28.37 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  25.95 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  26.04 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  27.93 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  24.44 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.52 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  25.83 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  29.58 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.56 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.3 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  27.06 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  23.53 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  26.51 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  23.65 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  26.43 
 
 		 505 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.45 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.8 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  26.06 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  27.7 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  28 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  33.08 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  26.17 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2592  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.75 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  30.22 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  25.6 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  24.83 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  30 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  30 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.26 
 
 		 372 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  28.46 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  28.46 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.91 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2309  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  26.24 
 
 		 513 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00141019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  33.63 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3599  two component Fis family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0326  NifA subfamily transcriptional regulator  29.92 
 
 		 733 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.399529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.1 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  28.3 
 
 		 657 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  30.47 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1753  FHA domain containing protein  30.23 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  28.33 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  28.78 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1542  Fis family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 586 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.115616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2426  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.95 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2769  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.5 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.3551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  28.83 
 
 		 328 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1643  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 444 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3503  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.95 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  25.82 
 
 		 340 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2273  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.95 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  21.05 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2724  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  25.53 
 
 		 723 aa  46.2  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00255153  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  33.62 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  33.62 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  33.62 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.59 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  24.83 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1266  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  29.41 
 
 		 724 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2338  sigma-54 factor, interaction region  28.15 
 
 		 612 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00232257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2625  formate hydrogenlyase transcriptional activator  26.9 
 
 		 648 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1739  Sigma 54 interacting domain protein  30.71 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1178  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  26.9 
 
 		 670 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0906  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  38.71 
 
 		 487 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000910984  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  25.33 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2773  formate hydrogenlyase transcriptional activator  26.9 
 
 		 670 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.309926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  26 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4608  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.48 
 
 		 666 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02345  hypothetical protein  26.9 
 
 		 670 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1347  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  28.67 
 
 		 1082 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02383  DNA-binding transcriptional activator, formate sensing  26.9 
 
 		 668 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3328  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1185  NifA subfamily transcriptional regulator  26.9 
 
 		 670 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.132433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2638  hydrogenase-4 transcriptional regulator  26.9 
 
 		 670 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3713  formate hydrogenlyase transcriptional activator  26.9 
 
 		 670 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.574322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0769  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.64 
 
 		 453 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1588  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 458 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  24.32 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.64 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  25.57 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.25 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0372  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  27.7 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  26.17 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.13 
 
 		 480 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3359  NifA subfamily transcriptional regulator  31.07 
 
 		 674 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3983  formate hydrogenlyase transcriptional activator  25.98 
 
 		 692 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.933844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.35 
 
 		 466 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3019  formate hydrogenlyase transcriptional activator  25.98 
 
 		 692 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>