147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0748 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  707    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  69.16 
 
 		 348 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  65.71 
 
 		 348 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  39.69 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  42.65 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.81 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.41 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.2 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  45.21 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  39.07 
 
 		 379 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  36.92 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  36.92 
 
 		 332 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.69 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  34.04 
 
 		 341 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  35.02 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  30.58 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  30.06 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  33.96 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  29.45 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  37.08 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  34.08 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  34.24 
 
 		 353 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  35.74 
 
 		 364 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  34.55 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.1 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  34.58 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  34.58 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  31.23 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  29.8 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  32.39 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  29.8 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  36.19 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  28.34 
 
 		 360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.42 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.11 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.47 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.7 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  34.71 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  27.36 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.97 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  34.71 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  31.84 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  31.84 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  30.71 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  35.15 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  32.6 
 
 		 352 aa  99.4  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.46 
 
 		 398 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  28.57 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  30.46 
 
 		 387 aa  89.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  26.21 
 
 		 489 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  28.26 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.64 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  25.58 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  27.68 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  25.59 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.49 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  24.8 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  30.68 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  26.05 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  23.96 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  25.36 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  25.53 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  27.4 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  25.1 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  23.27 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  26.29 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  24.81 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  27.06 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  36.45 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  30.72 
 
 		 4917 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  32.81 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  30.14 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  30.41 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  33.11 
 
 		 4979 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  29.73 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  34.26 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  27.08 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  33.33 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  33.33 
 
 		 267 aa  50.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23838  predicted protein  32.61 
 
 		 1879 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  33.94 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  33.08 
 
 		 272 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  28.76 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.45 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.64 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  35.05 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  34.69 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.48 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  28.97 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  34.02 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.23 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  32.99 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  32.77 
 
 		 272 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  29.01 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  31.78 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  34.75 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  32.35 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>