48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2921 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  729    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  96.32 
 
 		 353 aa  703    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  72.08 
 
 		 355 aa  531  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  68.75 
 
 		 353 aa  511  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  67.9 
 
 		 353 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  29.53 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  29.65 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  28.89 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  30.65 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  26.38 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  29.37 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  26.13 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  24.51 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  24.93 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  30.61 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  30.09 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  28.42 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  28.76 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  28.76 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  27.56 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  27.8 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  28.92 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  29.83 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  24.72 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  27.4 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  25.53 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  24.17 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.91 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.24 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  27.36 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.83 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  26.75 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  23.21 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  22.74 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  26.37 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  21.64 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  25.21 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.77 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.99 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  25.57 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  25.87 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  25.62 
 
 		 342 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  23.23 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  25.12 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  24.51 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  22.82 
 
 		 505 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.63 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.22 
 
 		 521 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>