44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0051 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  729    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  82.39 
 
 
353 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  70.94 
 
 
355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  67.9 
 
 
353 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  68.18 
 
 
353 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  30.56 
 
 
351 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  30.27 
 
 
351 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  30.03 
 
 
328 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  32.91 
 
 
302 aa  106  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  25.07 
 
 
360 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  28.23 
 
 
352 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  29.39 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  23.35 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  25.58 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  25.99 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.44 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  26.61 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  28.8 
 
 
372 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  25.53 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  25.08 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  21.76 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  28.28 
 
 
367 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  27.64 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  27.87 
 
 
379 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  22.56 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  22.01 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.18 
 
 
364 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  25.98 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.1 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  22.84 
 
 
387 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  29.65 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  27.13 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  28.5 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  28.5 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.73 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.77 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  27.14 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.33 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  27 
 
 
369 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  23.31 
 
 
334 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  25.65 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.31 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  24.21 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  21.57 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>