80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1546 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  761    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  42.37 
 
 
348 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  39.07 
 
 
347 aa  202  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.84 
 
 
330 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  42.37 
 
 
348 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  43.14 
 
 
340 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.95 
 
 
327 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  36.14 
 
 
327 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  38.65 
 
 
347 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  33.33 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  32.62 
 
 
332 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  34.1 
 
 
332 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.23 
 
 
364 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  36.68 
 
 
369 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  33.46 
 
 
369 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  38.78 
 
 
364 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  33.59 
 
 
368 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  39.17 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  33.08 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  35.36 
 
 
367 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  37.5 
 
 
372 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  37.5 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  34.55 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  32.66 
 
 
372 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.09 
 
 
354 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.22 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  32.09 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  32.09 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  31.1 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  28.22 
 
 
354 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  28.22 
 
 
354 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  31.86 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.14 
 
 
360 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  29.47 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  29.01 
 
 
342 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33 
 
 
418 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  29.77 
 
 
334 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.55 
 
 
367 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  29.58 
 
 
360 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  31.56 
 
 
351 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  31.15 
 
 
351 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  27.44 
 
 
352 aa  99.8  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  29.36 
 
 
328 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.72 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  32.49 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  31.91 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  27.27 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  21.33 
 
 
521 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.48 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  25.09 
 
 
359 aa  87  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  27.34 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  25.27 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  22.48 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  29.39 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  24.36 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  23.36 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.99 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  23.36 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  28.76 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.57 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  28.63 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  27.93 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  24.91 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  24.4 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  22.9 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  25.13 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  23.23 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  26.75 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  27.63 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1700  hypothetical protein  26.13 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0900  hypothetical protein  26.13 
 
 
465 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417212  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0212  hypothetical protein  26.13 
 
 
465 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  33.71 
 
 
442 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  24.56 
 
 
340 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  25.81 
 
 
318 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  26.09 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  29.68 
 
 
336 aa  43.1  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  33.71 
 
 
442 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  26.09 
 
 
319 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  26.09 
 
 
319 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>