165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0212 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0212  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  932    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0900  hypothetical protein  92.47 
 
 
465 aa  862    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417212  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1700  hypothetical protein  91.4 
 
 
465 aa  850    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15640  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  39.64 
 
 
436 aa  309  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1109  hypothetical protein  35.62 
 
 
435 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3420  protein of unknown function DUF815  36.55 
 
 
429 aa  259  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0091  hypothetical protein  34.92 
 
 
430 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2317  hypothetical protein  32.11 
 
 
474 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0244932  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3290  protein of unknown function DUF815  34.9 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2937  protein of unknown function DUF815  32.58 
 
 
485 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000616511  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1586  protein of unknown function DUF815  35.37 
 
 
440 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1275  hypothetical protein  35.04 
 
 
438 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0284  hypothetical protein  34.56 
 
 
452 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3284  protein of unknown function DUF815  40.31 
 
 
459 aa  239  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2796  protein of unknown function DUF815  34.34 
 
 
428 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3304  protein of unknown function DUF815  34.34 
 
 
428 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0393  hypothetical protein  35.4 
 
 
448 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.467349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4062  hypothetical protein  34.45 
 
 
435 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2854  hypothetical protein  32.76 
 
 
447 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0399662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0255  ATPase  31.18 
 
 
426 aa  230  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1080  protein of unknown function DUF815  31.56 
 
 
451 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1386  hypothetical protein  34.01 
 
 
442 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.187879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  38.41 
 
 
296 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  36.9 
 
 
297 aa  196  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  38.2 
 
 
292 aa  196  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  38.77 
 
 
296 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  41.37 
 
 
296 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  35.09 
 
 
297 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  37.01 
 
 
296 aa  192  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  37.45 
 
 
295 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  39.34 
 
 
296 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  38.74 
 
 
348 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  39.13 
 
 
295 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  38.55 
 
 
296 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  38.74 
 
 
295 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  38.34 
 
 
296 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  38.55 
 
 
296 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  37.92 
 
 
292 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  38.15 
 
 
293 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  37.92 
 
 
292 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  36.42 
 
 
325 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  37.55 
 
 
279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  37.55 
 
 
279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  40.23 
 
 
292 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  38.46 
 
 
289 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  36.59 
 
 
299 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  37.17 
 
 
278 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  36.92 
 
 
298 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0079  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
254 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.895882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  38.13 
 
 
290 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  35.86 
 
 
285 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  36.9 
 
 
294 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  36.88 
 
 
291 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  37.5 
 
 
296 aa  180  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  36.1 
 
 
294 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  38.82 
 
 
291 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  36.29 
 
 
300 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  37.18 
 
 
259 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  39.22 
 
 
290 aa  179  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  37 
 
 
289 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  38.18 
 
 
289 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  36.1 
 
 
323 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  38.18 
 
 
289 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  36.1 
 
 
323 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  36.56 
 
 
294 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  37.09 
 
 
293 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  37 
 
 
296 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  38.18 
 
 
289 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  36.63 
 
 
289 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  36.63 
 
 
289 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  38.17 
 
 
299 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  35.84 
 
 
294 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  36.76 
 
 
289 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  36.73 
 
 
289 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  36.73 
 
 
289 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  36.73 
 
 
289 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  36.79 
 
 
303 aa  176  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  36.73 
 
 
289 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  36.73 
 
 
289 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  36.73 
 
 
289 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  36.73 
 
 
289 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  36.46 
 
 
323 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0468  AAA ATPase family protein  42.28 
 
 
272 aa  176  8e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  36.76 
 
 
289 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  38.58 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  36.86 
 
 
289 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  36.92 
 
 
303 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  38.28 
 
 
284 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  38.19 
 
 
299 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  35.56 
 
 
283 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  38.49 
 
 
297 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  35.74 
 
 
291 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0715  ABC transporter ATPase  41.87 
 
 
254 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0689546  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  34.21 
 
 
292 aa  173  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  36.8 
 
 
306 aa  173  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  37.31 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  35.64 
 
 
318 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  38.26 
 
 
299 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  36.03 
 
 
298 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  36.43 
 
 
323 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>