106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1222 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  100 
 
 		 505 aa  1040    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.55 
 
 		 521 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  40.75 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  25.1 
 
 		 331 aa  94.4  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  26.24 
 
 		 340 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  23 
 
 		 348 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  24.07 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  24.48 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.3 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  24.76 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  24.07 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  25.93 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  25.58 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  24.27 
 
 		 332 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  23.81 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  22.48 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.23 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.94 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  25.96 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  27.18 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  24.28 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  21.88 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  26.44 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  25.29 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.94 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  24.64 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  28.02 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  25.71 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  25.71 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  24.17 
 
 		 327 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  26.02 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  25.77 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  25.77 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  27.81 
 
 		 367 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  20.57 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.12 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  28.47 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  23.32 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  26.43 
 
 		 365 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  21.69 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.2 
 
 		 361 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  23.5 
 
 		 369 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  26.88 
 
 		 302 aa  53.5  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  24.27 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.33 
 
 		 360 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  22.64 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  24.27 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.93 
 
 		 372 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.22 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  22.49 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  22.09 
 
 		 371 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  25.23 
 
 		 307 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.72 
 
 		 398 aa  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  26.99 
 
 		 362 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.45 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  24.7 
 
 		 599 aa  47.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.86 
 
 		 387 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  28.23 
 
 		 785 aa  47  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  22.6 
 
 		 353 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  21.08 
 
 		 341 aa  47  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  26.19 
 
 		 607 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 785 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  20.7 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  29.17 
 
 		 785 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  29.17 
 
 		 785 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  29.17 
 
 		 785 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  20.7 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 784 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 785 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 785 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 785 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 785 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  22.82 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 785 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  20.91 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.42 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 815 aa  45.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  28.23 
 
 		 783 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  20.98 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  28.33 
 
 		 785 aa  45.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  18.94 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  28.33 
 
 		 781 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  28.33 
 
 		 785 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  28.33 
 
 		 783 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  28.33 
 
 		 785 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  29.03 
 
 		 778 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02983  ATP-dependent protease La  27.42 
 
 		 809 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00208912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0821  ATP-dependent protease LA  29.84 
 
 		 787 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0118017  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  29.66 
 
 		 506 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  27.2 
 
 		 793 aa  44.3  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  28.81 
 
 		 824 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  28.33 
 
 		 813 aa  43.9  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 810 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  26.61 
 
 		 798 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  29.03 
 
 		 783 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  27.42 
 
 		 788 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  26.61 
 
 		 798 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  23.05 
 
 		 368 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  24.77 
 
 		 306 aa  43.9  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  26.61 
 
 		 797 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>