More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0954 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  100 
 
 
307 aa  615  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  76.64 
 
 
304 aa  502  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  77.96 
 
 
304 aa  499  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  78.74 
 
 
306 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  57.1 
 
 
334 aa  355  5.999999999999999e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  35.48 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.96 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.06 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  33.33 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0582  hypothetical protein  31.94 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  28.15 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.08 
 
 
351 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  28.85 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  34.76 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  34.38 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.16 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.73 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.84 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  34.78 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  32.34 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  34.07 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  31.76 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  33.52 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.98 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  34.76 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  35.29 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  31.79 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  35.5 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  35.29 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  36.52 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  34.22 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  30.54 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  33.71 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.37 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.829729  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  36.52 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.78 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.43 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  32.28 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.17 
 
 
325 aa  79  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  33.33 
 
 
349 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0902  ATPase  35.26 
 
 
335 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  32.46 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.09 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  28.49 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  34.24 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  34.68 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  33.16 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  31.41 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  33.33 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  28.89 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  34.33 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1589  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.98 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0629676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  30.6 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.05 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.46 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.35 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  33.51 
 
 
335 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  34.68 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.82 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.49 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  30.59 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  34.97 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  31.79 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.52 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  31.98 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.05 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  32.64 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  33.93 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  31.94 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  35.96 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  26.47 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.64 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.79 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  32.93 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  28.25 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  32.57 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  30.98 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.31 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  33.83 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  31.31 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  28.82 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.21 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.64 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  31.36 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.49 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.95 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  29.55 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.58 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.01 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.12 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.95 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.67 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  30.77 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  32.02 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.71 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  29.35 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.13 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  33.74 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.9 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>